Struktur/Funktions-Beziehungen der sigma S-haltigen "Stress"-RNA-Polymerase in Escherichia coli

大肠杆菌中含有 sigma S 的“应激”RNA 聚合酶的结构/功能关系

• 批准号: 5424677
• 负责人: Professorin Dr. Regine Hengge
• 金额: --
• 依托单位: Arbeitsgruppe Mikrobiologie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2003-12-31 至 2006-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5424677?language=en
• 关键词: Struktur; Funktions; Beziehungen; der; sigma

Im Modellorganismus Escherichia coli erkennen die vegetative RNA-Polymerase Es70 und die "Stress"-RNAP Ess die gleichen Kernpromotoren (-35:TTGACA, -10:TATAAT), aktivieren aber in vivo völlig unterschiedliche Gene. Ess-Selektivität wird dabei durch unterschiedliche Kombinationen verschiedener Zusatzelemente in diesen Promotoren erreicht (u.a. eine distale UP-Element-Halbseite, stärker degenerierte -35 Region oder -35/-10Spacerlänge). Wie die in diesen Elementen enthaltene Information von den beiden RNAP-Varianten strukturell unterschiedlich decodiert wird, ist weitgehend unbekannt. Mit Hilfe von nunmehr vorliegenden RNAP-Kristallstrukturen lassen sich jedoch präzise Vorhersagen machen, welche Aminosäuren an welchen Interaktionen beteiligt sein könnten. Die generelle Strategie im vorliegenden Projekt wird daher darin bestehen, diese Aminosäuren in ss gegen die an diesen Positionen in s70 vorhandenen Aminosäuren auszutauschen, und diese Konstrukte auf ss- oder s70-ähnliches Transkriptionsinitiationsverhalten zu testen, und zwar unter Zuhilfenahme einer bereits vorhandenen großen Kollektion von Promotoren, bei denen die verschiedenen Ess-Selektivität erzeugenden Elemente einzeln oder in Kombination vorhanden sind. Diese Kombination verschiedener Sigmafaktor-Varianten mit verschiedenen Promotorvarianten entspricht formal einer genetischen allel-spezifischen Suppressoranalyse, erlaubt daher Schlussfolgerungen über direkte molekulare Interaktionen von ss- und s70 mit verschiedenen Promotorelementen und ergibt damit eine strukturelle Basis für die unterschiedliche Promotorselektivität der vegetativen und der "Stress"-RNA-Polymerase.

在模拟生物体大肠杆菌中，发现了营养型RNA聚合酶Es 70和“应激”-RNAP Ess的核启动子（-35：TTGACA，-10：TATAAT），激活了体内的非干扰基因。选择性将通过在促销活动中使用不同的组合来实现（美国）。一个远端UP-元素-Halbseite，stärker退化-35区域或-35/-10间隔区）。如何在这些基本的信息从beidenRNAP-Variantenstrukturellunterschedulichdecodiertwird，是未知的。Mit Hilfe von nunmehr vorliegenden RNAP-Kristallstrukturen lassen sich jedoch präzise Vorhersagen machen，welche Aminosäuren an welchen Interaktionen beteiligt sein könnten.在前一个项目中，一般的方法是最好的，在前一个项目中的氨基在前一个项目中的位置，在前一个项目中的结构在前一个项目中的位置，在前一个项目中的结构在前一个项目中这种组合验证Sigmafaktor-Varianten与验证Promotorvarianten的组合，正式启动了一种遗传学等位基因特异性抑制剂分析，并通过验证Promotorelementen和ergibt damit eine strukturelle Basis für die unterschedliche Promotorselektivität der vegetativen und der“Stress”-RNA-Polymerase，使ss-和s70的Schlussfolgerungen über direkte molekulare Interaktionen。