Flexible and Robust Nonlinear Statistical Modeling Based on High-Dimensional Complex Heterogeneous Data Analysis

基于高维复杂异构数据分析的灵活鲁棒非线性统计建模

• 批准号: 20680016
• 负责人: IMOTO Seiya
• 金额: $ 13.15万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20680016/
• 关键词: 高次元データ解析; 異種データ統合; ベイズ統計; ロバスト; 超高次元データ; ヘテロデータ; 情報統合; ベイズモデル; 階層モデル

We developed robust statistical methods for extracting valuable information from various types of high-dimensional heterogeneous data. As the results, when a subset of feature variables is defined a priori, we develop a series of statistical methods that can evaluate whether the subset has a unique distribution by comparing with background variables in the given large dataset. We also proposed a robust estimation method for large gene network from microarray gene expression data and other types of data like transcription binding sites and applied it to the analysis of cancer heterogeneity.

我们开发了强大的统计方法，从各种类型的高维异构数据中提取有价值的信息。作为结果，当一个子集的特征变量被定义的先验，我们开发了一系列的统计方法，可以评估是否有一个独特的分布，通过比较在给定的大数据集的背景变量的子集。我们还提出了一种基于微阵列基因表达数据和转录结合位点等其他类型数据的大基因网络鲁棒估计方法，并将其应用于癌症异质性分析。

项目成果

Computational Drug Target Pathway Discovery : A Bayesian Network Approach. (Handbook of Computational Statistics : Statistical Bioinformatics)(in H.Lu, B.Schokop, H.Zhao (Eds.))

计算药物靶标途径发现：贝叶斯网络方法。

• 发表时间: 2010
• 作者: S.Imoto;Y.Tamada;H.Araki;S.Miyano
• 通讯作者: S.Miyano

Bayesian learning of biological pathways on genomic data assimilation

基因组数据同化生物途径的贝叶斯学习

• 发表时间: 2008
• 期刊: Bioinformatics Vol.24, No.22
• 作者: R. Yoshida;M. Nagasaki;R. Yamaguchi;S. Imoto;S. Miyano;T. Higuchi
• 通讯作者: T. Higuchi

Optimal Search on Clustered Structural Constraint for Learning Bayesian Network Structure

• DOI: 10.5555/1756006.1756015
• 发表时间: 2010-03
• 期刊: J. Mach. Learn. Res.
• 作者: Kaname Kojima;Eric Perrier;S. Imoto;S. Miyano

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Gene set-based module discovery decodes cis-regulatory codes governing diverse gene expression across human multiple tissues

基于基因集的模块发现解码了控制人类多个组织不同基因表达的顺式调控代码

• 发表时间: 2010
• 期刊: PLoS One.
• 作者: Niida A;et al.(その他4人)
• 通讯作者: et al.(その他4人)