Rational strategy of tuning protein-complex function by ligand

通过配体调节蛋白质复合物功能的合理策略

• 批准号: 20750133
• 负责人: MIZUNO Toshihisa
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Nagoya Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20750133/
• 关键词: ナノバイオ; 蛋白質; バイオテクノロジー

As a model system of protein-protein interaction, we chose the T7 RNA polymerase-T7 lysozyme pair in this research. By inserting the originally designed coiled-coil protein, which transform its tertiary structure from random coil to coiled-coil structure by the specific ligand peptide, into the T7 lysozyme, we succeeded in tuning the interaction between T7 RNA polymerase and T7 lysozyme by the binding of specific ligand peptide. On the other hand, we also succeeded in constructing the ligand-binding protein, which exhibits a reversible structural alteration following the specific ligand binding. Interestingly, this protein can work even in the in vivo circumstances. By combining this designed ligand-binding protein with various target natural proteins, ligand-binding tuning of protein-protein interactions should be possible in future.

作为蛋白质-蛋白质相互作用的模型系统，我们选择了T7 RNA聚合酶-T7溶菌酶对作为研究对象。通过将设计的卷曲螺旋蛋白插入T7溶菌酶中，利用特异性配体肽将其三级结构从无规卷曲转变为卷曲螺旋，成功地通过特异性配体肽的结合调节了T7 RNA聚合酶与T7溶菌酶的相互作用。另一方面，我们还成功地构建了配体结合蛋白，其在特异性配体结合后表现出可逆的结构改变。有趣的是，这种蛋白质甚至可以在体内环境中工作。通过将这种设计的配体结合蛋白与各种目标天然蛋白质相结合，将来蛋白质-蛋白质相互作用的配体结合调节应该是可能的。

项目成果

Target-selective vesicle fusion system with pH-selectivity and responsiveness

• DOI: 10.1039/b909503a
• 发表时间: 2009-01-01
• 期刊: SOFT MATTER
• 影响因子: 3.4
• 作者: Kashiwada, Ayumi;Tsuboi, Mana;Matsuda, Kiyomi
• 通讯作者: Matsuda, Kiyomi

3本鎖ヘテロコイルドコイルを用いたT7リゾチームの活性制御

使用三链杂螺旋控制 T7 溶菌酶活性

• 发表时间: 2008
• 作者: 鈴木久美子;水野稔久;工藤基徳;津本浩平;織田昌幸;田中俊樹
• 通讯作者: 田中俊樹

Zn結合性3本鎖α-ヘリカルコイルドコイル蛋白質の設計

锌结合三链α-螺旋卷曲螺旋蛋白的设计

• 发表时间: 2009
• 作者: 大草宏一;水野稔久;田邊陽一;織田昌幸;田中俊樹
• 通讯作者: 田中俊樹

de novo設計ポリペプチドを用いたpH応答型ベシクル融合系の構築

使用从头设计的多肽构建 pH 响应性囊泡融合系统

• 发表时间: 2008
• 作者: 柏田歩;坪井茉奈;松田清美;水野稔久;田中俊樹
• 通讯作者: 田中俊樹

Construction of a pH-responsive artificial membrane fusion system by using designed coiled-coil polypeptides

• DOI: 10.1002/chem.200701726
• 发表时间: 2008-01-01
• 期刊: CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL
• 影响因子: 4.3
• 作者: Kashiwada, Ayumi;Matsuda, Kiyomi;Tanaka, Toshiki
• 通讯作者: Tanaka, Toshiki