Comparative evolutionary studies on three-dimensionally positioning of the chromosome territories in the primate iPS cell nuclei

灵长类 iPS 细胞核中染色体区域三维定位的比较进化研究

• 批准号: 21602002
• 负责人: TANABE Hideyuki
• 金额: $ 3.16万
• 依托单位: The Graduate University for Advanced Studies
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21602002/
• 关键词: 染色体テリトリー; 3D-FISH法; 核内配置; 細胞分化; 遺伝子ポジショニング; 霊長類iPS細胞; ゲノム配置; 生細胞蛍光観察

In this study from the viewpoint of spatial positioning of chromosome territories and genomic regions within the nucleus I would try to find the molecular mechanism of why the iPS cells are established and to identify what the human specific characteristics have been appeared during the course of primate evolution by comparative analysis in human and great apes. Analysis by 3D-FISH technique using the DNA probes with Oct3/4, Sox2, Klf4, c-Myc, and Nanog, and their chromosomal paints onto human, chimpanzee, gorilla, and orangutan fibroblast cell nuclei, basic characteristics of spatial arrangements have been revealed but analysis has not yet been carried out due to shortage of primate iPS cells. When accumulating iPS cells, I would perform the analyses and discuss the issues.

在这项研究中，我将从细胞核内染色体区域和基因组区域的空间定位的角度出发，试图找到iPS细胞形成的分子机制，并通过对人类和类人猿的比较分析来确定人类在灵长类进化过程中出现的特定特征。使用Oct3/4、Sox2、Klf4、c-Myc和Nanog的DNA探针及其染色体涂料对人类、黑猩猩、大猩猩和猩猩成纤维细胞核进行3D-FISH技术分析，已经揭示了空间排列的基本特征，但由于灵长类iPS细胞的短缺，尚未进行分析。当积累iPS细胞时，我会进行分析并讨论问题。

项目成果

核内染色体テリトリーの放射状核内配置の特性について

核染色体区放射状核排列的特点

• 发表时间: 2009
• 作者: M.Ueda;Y.Nakamura;田辺秀之;大坪素秋;Uemura Y;田辺秀之
• 通讯作者: 田辺秀之

3D-repositioning of chromosome territories leading to primate karyotypic evolution

染色体区域的 3D 重新定位导致灵长类动物核型进化

• 发表时间: 2010
• 作者: 中村葉子;猪俣翔;A.Mithofer;W.Boland;上田実;Hideyuki Tanabe
• 通讯作者: Hideyuki Tanabe

Kissing of chromosome territories leading to chromosomal translocation and genomic evolution

染色体区域的亲吻导致染色体易位和基因组进化

• 发表时间: 2009
• 作者: 中村葉子;浜本晋;猪俣翔;魚住信之;上田実;Hideyuki Tanabe
• 通讯作者: Hideyuki Tanabe

細胞核と染色体構造の動態:核内空間配置に関する分子基盤について

细胞核和染色体结构的动力学：细胞核内空间排列的分子基础

• 发表时间: 2011
• 作者: Ohno;Y.;Yasunaga;S.;Ohtsubo;M.;Mori;S.;Tsumura;M.;Okada;S.;Ohta;T.;Ohtani;K.;Kobayashi;M.;Takihara;Y.;田辺秀之
• 通讯作者: 田辺秀之

Chromosome kissing due to 3D-repositioning of chromosome territories leading to primatekaryotypic evolution

由于染色体区域 3D 重新定位导致的染色体接吻导致灵长类动物核型进化

• 发表时间: 2011
• 作者: Hideyuki Tanabe;Takafumi Ishida;Hirohisa Hirai
• 通讯作者: Hirohisa Hirai