Protein domain interaction networks in yeast: high-throughput analysis using two-hybrid-arrays
Protein domain interaction networks in yeast: high-throughput analysis using two-hybrid-arrays
批准号:
5382702
负责人:
Dr. Peter Uetz
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2002
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2001-12-31 至 2005-12-31
中文摘要
ProteinInteraktionen sind wesentlich für alle Prozesse in Allen Organisman.我们认为,这是一种新的组织形式和身份识别。大足钢丝网改进型双混联系统,共6000个单元,全部采用Einem阵列格式。双混合阵列Können Weitgehend Automatisiert MIT Roboterhelfe gescreent Wen den and haben den Vorteil,dass sie Falsch阳性weitgehend auschliessen.Domänen(“Domänen”)。Schliesslich könnnen双混合网版如Interaktionen识别网,死在gereinigten komplexen niht stabil erhalten bleiben,D.H.这是一种短暂的互换。Besondere Aufmerksamkeit将在Interaktionen von Proteinen and Proteindomänen unbekannter Funktion小工具上工作。这是一项新的实验,目的是为了证实这一点。在此基础上,提出了一种新的质量分析方法,即双杂交试验。[参考译文]Schliesslich Sollen蛋白质相互作用实验验证和破坏生物信息-方法zur Vorhersage von Proteinfunktionen Veressert。Zunächst Wen Fgende Proteindomänen untersuht:DEP,PX,FF,CNH。
英文摘要
Proteininteraktionen sind wesentlich für alle Prozesse in allen Organismen. Wir wollen möglichst viele Proteininteraktionen im Modellorganismus Hefe identifizieren. Dazu verwenden wir ein von uns entwickeltes modifiziertes two-hybrid-System, für das wir alle 6000 Hefegene kloniert und in einem Arrayformat angeordnet haben. Two-hybrid-Arrays können weitgehend automatisiert mit Roboterhilfe gescreent werden und haben den Vorteil, dass sie Falsch-Positive weitgehend ausschliessen. Die Methode erlaubt ausserdem die genaue Kartierung von interagierenden Proteinabschnitten ("Domänen"). Schliesslich können two-hybrid screens auch Interaktionen identifizieren, die in gereinigten komplexen nicht stabil erhalten bleiben, d.h. schwache oder transiente Interaktionen. Besondere Aufmerksamkeit wird den Interaktionen von Proteinen und Proteindomänen unbekannter Funktion gewidmet. Interaktionen mit bekannten Proteinen führen damit zu experimentell verifizierbaren Hypothesen. Unser Verfahren ergänzt auch sehr gut andere Methoden wie z.B. die massenspektrometrische Analyse von Proteinkomplexen, deren Topologie mit two-hybrid-Tests aufgeklärt werden kann. Schliesslich sollen theoretisch vorhergesagte Proteininteraktionen experimentell verifiziert und damit Bioinformatik-Methoden zur Vorhersage von Proteinfunktionen verbessert werden.Zunächst werden folgende Proteindomänen untersucht: DEP, PX, FF, CNH.
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科研奖励(0)
会议论文
Functional analysis of conserved hypothetical proteins in prokaryotes
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批准号:12775233
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2005
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负责人:Dr. Peter Uetz
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依托单位:
国内基金
海外基金
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