日本列島の二つのレフュージアが日本産哺乳類の遺伝的多様性に与えた影響の検証

研究日本列岛的两个避难所对日本哺乳动物遗传多样性的影响

基本信息

  • 批准号:
    09J02319
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.28万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2009
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2009 至 2010
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

申請者は、日本産哺乳類の遺伝的多様性の創出要因について調査するため、ニホンノウサギを対象にして分子系統地理学的解析を行った。mtDNA、Y染色体DNAおよび常染色体DNA5座位を用いて、当該種の遺伝的多様性について調べた。その結果、ニホンノウサギは、第四紀の日本列島に形成された複数の避寒地を中心に集団の拡大と縮小を繰り返し、その遺伝的多様性を獲得しことが示唆された。しかしニホンノウサギにみられる冬季毛色の異なる2集団(白化・非白化集団)が、遺伝的集団構造に与える影響について調べる必要があると考えられた。これまで哺乳類の毛色変異に関する主な遺伝子としてasip、tyr、mclrが知られている。これらの遺伝子の一部を調べたところでは、冬季毛色との関連を示す地理的変異は見つからなかった。上記の3つの遺伝子は一生涯続く毛色の変異を引き起こすため、ニホンノウサギのような毛色の季節変化の有無については、別の遺伝子の変異に起因する可能性が考えられた。また、核遺伝子の調査を進める中で、光周性関連遺伝子tshbの変異に独自の地理的分布がみられた。Tshbは調べた他の5つの核遺伝子とは異なり、自然選択検定において有意な負の値を示し、また遺伝的変異と地理的距離との相関もみられなかった。ニホンノウサギの白化型と非白化型は、毛色や生殖腺の季節変化と日長刺激との間に関連があることが報告されている。このことからTshbの遺伝的変異には自然選択の影響が働いている可能性が考えられた。今後、カイウサギのゲノム情報を基に、ニホンノウサギで利用可能なサテライトマーカーを探索し、2集団特異的な変異を持つ遺伝子座と、より網羅的な遺伝子流動について解析を進める。
The applicant is responsible for the investigation of the origin of polymorphism of mammals in Japan, and the analysis of molecular phylogeography of the Japanese mammals. mtDNA, Y-chromosome DNA autosomal DNA locus 5 is used, and it is a polygonal polymorphism of the species. The results of その, the ニホンノウサギは, the quaternary period of the Japanese archipelago, the formation of されたplural のrefrigeration placeを中The heart's collection is large and narrow, and the multiple nature of the remaining parts is obtained.しかしニホンノウサギにみられるWinter coat color のdifferent なる 2 volumes (albino・non-albino collection ), the collective structure of the legacy and the influence of the group are necessary to adjust the structure of the group.これまでMammalsのcoat color differenceに关する主な伝子としてasip, tyr, mclrが知られている.これらの缝子の一一を动べたところでは, winter coat color とのrelated をshowing the geographical difference つからなかった. The last record of の3 つ の 伝子 は a career 続 く の変 different を inducing き こ す た め 、 ニ ホ ン ノ ウ サ ギ の よ うThere is no seasonal change in fur color, there is no change, and there is no possibility of changing the color of the hair.また, nuclear legacy 伝子のinvestigation を める中で, photoperiodic correlation legacy 伝子 tshb の変different に unique の geographical distribution がみられた. Tshbは夜定において有The meaning of the meaning is the difference between the meaning and the geographical distance. The albino and non-albino types of ニホンノウサギの, the coat color, the seasonal change of the gonads, the day length stimulation, the relationship between the があることが report and the されている.このことからTshbの伝's difference にはnatural selection択のinfluenceが働いているpossibilityが考えられた. From now on, it is possible to use カイウサギのゲノムinformation and ニホンノウサギでなサテライトマーカーを Detective So, the 2nd episode of the special な変different をhold つ伝子杨, より网上的な伝子流 についてanalytic を进める.

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Detection of recombinant haplotypes in wild mice (Mus musculus) provides new insights into the origin of Japanese mice
  • DOI:
    10.1111/j.1365-294x.2010.04651.x
  • 发表时间:
    2010-06-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Nunome, Mitsuo;Ishimori, Chikako;Suzuki, Hitoshi
  • 通讯作者:
    Suzuki, Hitoshi
日本産哺乳類における毛色変異と系統地理
日本哺乳动物的毛色变化和系统发育地理学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    布目三夫;友澤森彦;佐藤淳;鈴木仁
  • 通讯作者:
    鈴木仁
A role of Pleistocene refugia in shaping genetic diversity of the Japanese hare, Lepus brach yurus
更新世避难所在塑造日本兔 Lepus brach yurus 遗传多样性中的作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Mitsuo Nunome;Harumi Torii;Rikyu Matsuki;Fumio Yamada;Kimiyuki Tsuchiya;Hitoshi Suzuki
  • 通讯作者:
    Hitoshi Suzuki
ニホンノウサギのTshb遺伝子における地理的変異と自然選択の影響の検証
验证地理变异和自然选择对日本野兔 Tshb 基因的影响
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    布目三夫;鳥居春巳;松木吏弓;木下豪太;山田文雄;鈴木仁;松田洋一
  • 通讯作者:
    松田洋一
複数遺伝子座を用いたニホンノウサギ4亜種の遺伝的背景の解析
利用多基因位点分析日本兔四个亚种的遗传背景
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    布目三夫;鳥居春己;松木吏弓;木下豪太;鈴木仁
  • 通讯作者:
    鈴木仁
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  • 通讯作者:
    井鷺 裕司

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