真核生物におけるtRNAスプライシングエンドヌクレアーゼの基質認識機構の解析

真核生物tRNA剪接核酸内切酶底物识别机制分析

• 批准号: 09J05512
• 负责人: 小野寺 瑛宣
• 金额: $ 0.9万
• 依托单位: Rikkyo University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-09J05512/
• 关键词: tRNAスプライシング; スプライシングエンドヌクレアーゼ; C.merolae; シゾン; 酵母Two-Hybrid法; transfer RNA; tRNA splicing endonuclease; Cyanidioschyzon merolae

1.C.merolaeのtRNAスプライシングエンドヌクレアーゼの取得とその活性の解析出芽酵母ゲノムとの相同性検索によって見出されたC.merolaeのtRNAスプライシングエンドヌクレアーゼ遺伝子候補であるCmSen2,CmSen 34,CmSen 54から各タンパク質を大腸菌を宿主にして産生させる試みを行った。様々な培養条件を試みた結果、低温培養によりCmSen2、CmSen34が可溶性のタンパク質として得られた。これらのタンパク質を精製し、基質RNAと混合したが、エンドヌクレアーゼ活性は検出されなかった。複数のサブユニットを同時に発現させることにより活性型タンパク質の取得が成功した例が報告されているため、3種のCmSenサブユニットを同時に発現させるために単一のプラスミド上に3種のCmSenをクローニングしたプラスミドを作成し、同時発現系を構築した。その結果、3種ともに可溶性のタンパク質として得られたが、CmSen54の発現量が低く、引き続き発現の条件検討を行っている。2.酵母Two-Hybrid法によるエンドヌクレアーゼサブユニットに相互作用するタンパク質の探索酵母Two-Hybrid法により、CmSen2,CmSen34,CmSen54のそれぞれをbaitにして、相互作用するタンパク質を探索した。その結果、CmSen2をbaitにした場合、Cmsen54との相互作用が示唆された。この結果は、3つのサブユニットが会合して機能している可能性を支持する。出芽酵母では、上述の3つに加えてもう1つのSen 15がtRNAスプライシングエンドヌクレアーゼのサブユニットであるが、C.merolaeの配列の相同性からはSen15は見いだせなかった。本解析により、機能的にSen15に相当するタンパク質が同定できることを期待して解析を続けている。

1. The identification of C. merolae tRNA primordia and the identification of its activity in yeast. The identification of C.merolae tRNA primordia and its activity in E. coli. CmSen2, CmSen34 and CmSen2 were cultured at low temperature. The quality of the product is refined, the matrix RNA is mixed, and the activity of the product is reduced. The successful acquisition of multiple active species was reported in the report. Three species of CmSen were simultaneously discovered. Three species of CmSen were simultaneously discovered. The results showed that three kinds of soluble compounds were obtained, the amount of CmSen54 was low, and the conditions for the occurrence of CmSen54 were discussed 2. Yeast Two-Hybrid Method: Yeast As a result, CmSen2 baits and CmSen54 interact with each other. This result supports the possibility of a convergence function. 3. The sequence identity of C.merolae is similar to that of C.merolae. This analysis, the function of Sen15, is equivalent to the quality of the same, and the expected analysis is not included.