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Analysis of interaction, ion transport and structural change in a stator complex of bacterial flagellar motor

细菌鞭毛运动定子复合体中相互作用、离子传输和结构变化的分析

基本信息

批准号：
21770166
负责人：
SUDO Yuki
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2009
资助国家：
日本
起止时间：
2009 至 2010
项目状态：
已结题

项目摘要

Motile microorganisms, such as bacteria and archaea, sense and respond to extracellular stimuli by changing their swimming mode to migrate towards more favorite habitats. In this research, we analyzed interaction, ion transport and structural changes in a stator complex of the bacterial flagellar motor using biophysical techniques. By means of attenuated total reflection Fourier-transform infrared spectroscopy, we directly observed binding of Na^+ to carboxylates in the Pom/B complex, including the functionally essential residue Asp24 (Sudo et al.2009b, Biochemistry). We also demonstrated that Ala39-MotB and Cys31-PomB form part of the ion flux pathway (Sudo et al. 2009, Biophysics), and reported the crystal structure of C-terminal region of MotB (Kojima et al. 2009, Mol.Microbiol.). Moreover we found and characterized new receptor proteins (Suzuki et al. 2009, J.Mol.Biol., Sudo et al.2009a, Biochemistry, Yagasaki et al.2010, Biochemistry, Sudo et al. 2011, J.Biol.Chem.).

可移动的微生物，如细菌和古生菌，通过改变它们的游泳模式来感知和响应细胞外的刺激，以迁移到更受欢迎的栖息地。在这项研究中，我们利用生物物理技术分析了细菌鞭毛马达定子复合体中的相互作用、离子传输和结构变化。通过衰减全反射傅里叶变换红外光谱，我们直接观察到Na~+与POM/B复合体中的羧酸盐的结合，包括功能必需的残基Asp24(Sudo等人，2009b，生物化学)。我们还证明了Ala39-MOTB和Cys31-Pomb构成了离子通量途径的一部分(Sudo等人。2009年，生物物理学)，并报道了MOTB的C-末端区域的晶体结构(Kojima等人。2009年，Mol.Microbiol.)此外，我们发现并鉴定了新的受体蛋白(Suzuki et al.2009年，J.Mol.Biol.，Sudo等人，2009a，生物化学，Yagaki等人，2010，BioChemical，Sudo等人。2011年，J.Biol.Chem.)。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

ロドプシン研究はどこに行くのか?"

视紫质研究将走向何方？”

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
生物物理 50
影响因子：
0
作者：
Yagasaki;J.;Suzuki.;D.;Ihara;K.;Inoue;K.;Kikukawa;T.;Sakai;M.;Fujii;M.;Homma;M.;Kandori;H.;Sudo;Y.;Shingo Kato;須藤雄気
通讯作者：
須藤雄気

Assignment of the essential Na+ binding of a stator unit for torque generation of bacterial flagellar motor by ATR-FTIR spectroscopy

通过 ATR-FTIR 光谱分配用于细菌鞭毛马达扭矩产生的定子单元的必需 Na 结合

DOI：
发表时间：
2009
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sudo Y;Kitade Y;Furutani Y;Kojima M;Kojima S;Homma M;Kandori H.
通讯作者：
Kandori H.

Phototactic and chemotactic signal transduction by transmembrane receptors and transducers in microorganisms

微生物中跨膜受体和传感器的趋光和趋化信号转导

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
Sensors 10
影响因子：
0
作者：
Suzuki;D.;Irieda;H.;Homma;M.;Kawagishi;I.;Sudo;Y.
通讯作者：
Y.

アナベナセンサリーロドプシンを利用したタンパク質発現法

使用鱼腥藻感觉视紫红质的蛋白质表达方法

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Spectroscopic studies of a sensory rhodopsin I homologue from the archaeon Haloarcula vallismortis

古细菌 Haloarcula vallismortis 感觉视紫红质 I 同系物的光谱研究

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
Biochemistry
影响因子：
2.9
作者：
J. Yagasaki;D. Suzuki;K. Ihara;K. Inoue;T. Kikukawa;M. Sakai;M. Fujii;M. Homma;H. Kandori;Y. Sudo
通讯作者：
Y. Sudo