前立腺癌のゲノムワイド関連解析

前列腺癌的全基因组关联分析

• 批准号: 10J02102
• 负责人: 赤松 秀輔
• 金额: $ 1.34万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10J02102/
• 关键词: 遺伝子多型; 癌罹患; 前立腺癌

当該年度においては、まず、GWASにおいて日本人の前立腺癌罹患との関連が確認された16の単塩基多型を用いて日本人の前立腺癌患者689人、対照群749人の情報を基にロジスティック回帰分析による罹患リスクモデルを構築した。次に、モデルの再現性を全く独立した2つの日本人サンプル(前立腺癌患者3,294人、対照群6,281人)を用いて確認した。その結果、リスクモデルを構築したサンプル群におけるモデルの曲線下面積(AUC)は0.679、再現性評価に用いた2群におけるAUCは0.655,0.661であり、高い再現性が確認された。さらに、カルフォルニアおよびハワイに在住する日系人サンプルにおいても高い再現性が認められた。次に、罹患リスクモデルとPSAの関連の有無について検討した。PSA1-10ng/mlのサンプルに限定した場合においてもAUCはほぼ同等であり、リスクスコアとPSAの間にも相関は認められず、リスクモデルがPSAとは独立した指標であることが確認された。最後に、PSAグレーゾーンにおいて罹患リスクモデルを適用した場合の検査後確率についてシミュレーションを行い、罹患リスクモデルの臨床における有用性について検討した。リスクモデルによって24.2%のサンプルが低リスク(オッズ<0.5)、9.7%のサンプルが高リスク(オッズ>2.0)と分類された。PSAグレーゾーンにおける前立腺癌診断率を20%と想定した場合にリスクモデルを適用すると低リスク、高リスク群における検査後確率はそれぞれ10.7%,42.4%であり、臨床において有用な指標になる可能性が示唆された。本研究において単塩基多型に基づく前立腺癌罹患リスクモデルは高い再現性を示し、PSAと完全に独立した指標であった。PSAグレーゾーンにおいて適用することで、高リスク群は即時前立腺生検、低リスク群はPSA経過観察するといった臨床判断に影響を与えうる指標であることが確認された。今後、実臨床現場においての精度、再現性、有用性の確認が待たれる。

In 2006, the association between Japanese prostate cancer and GWAS was confirmed. The association was based on information from 689 Japanese patients with prostate cancer and 749 Japanese patients with multiple types of cancer. Second, the reproducibility of the disease was completely independent. Two Japanese patients (3,294 patients with prostate cancer and 6,281 patients in the control group) were confirmed by the middle test. Results: Area under the curve (AUC) was 0.679, reproducibility evaluation was 0.655, AUC was 0.661, high reproducibility was confirmed. In the past, the Japanese people have been living in the middle of the world. Next, there is no correlation between the disease and PSA. PSA1-10ng/ml is a standard, independent indicator of PSA. Finally, the PSA classification system is used to investigate the clinical usefulness of the diagnosis system. 24.2% of the samples were classified as low (=<0.5), 9.7% as high (=>2.0). The diagnostic accuracy of PSA in patients with advanced adenocarcinoma was 20% and 42.4% respectively. The diagnostic accuracy of PSA in patients with advanced adenocarcinoma was 10.7% and 42.4% respectively. The diagnostic accuracy of PSA in patients with advanced adenocarcinoma was 20% and 42.4% respectively. In this study, the incidence of multi-type prostate cancer was significantly higher than that of non-type prostate cancer. The PSA test results indicate that the PSA test results indicate that the PSA test results are accurate and accurate. In the future, the accuracy, reproducibility, and usefulness of clinical field tests will be confirmed.

项目成果

A functional variant in NKX3.1 associated with prostate cancer susceptibility down-regulates NKX3.1 expression

• DOI: 10.1093/hmg/ddq350
• 发表时间: 2010-11-01
• 期刊: HUMAN MOLECULAR GENETICS
• 影响因子: 3.5
• 作者: Akamatsu, Shusuke;Takata, Ryo;Nakagawa, Hidewaki
• 通讯作者: Nakagawa, Hidewaki

Four loci at 11q12, 10q26, 3p11.2, and 2p11 are associated with prostate cancer susceptibility in Japanese

11q12、10q26、3p11.2 和 2p11 的四个位点与日本人前列腺癌易感性相关

• 发表时间: 2012
• 作者: Akamateu S;Takata R;Kamatani N;Fujioka T;Ogawa O;Kubo M;Nakamura Y;Nakagawa H.;赤松秀輔;赤松秀輔;赤松秀輔;赤松秀輔
• 通讯作者: 赤松秀輔

日本人における前立腺癌罹患関連領域として11q12, 10q26, 3p11.2,および2p11領域が新規に同定された。

11q12、10q26、3p11.2 和 2p11 区域被新确定为与日本患者前列腺癌相关的区域。

• 发表时间: 2012
• 作者: Akamateu S;Takata R;Kamatani N;Fujioka T;Ogawa O;Kubo M;Nakamura Y;Nakagawa H.;赤松秀輔;赤松秀輔;赤松秀輔
• 通讯作者: 赤松秀輔

Reproducibility, performance, and clinical utility of a genetic risk prediction model for prostate cancer in Japanese.

• DOI: 10.1371/journal.pone.0046454
• 发表时间: 2012
• 期刊: PloS one
• 影响因子: 3.7
• 作者: Akamatsu S;Takahashi A;Takata R;Kubo M;Inoue T;Morizono T;Tsunoda T;Kamatani N;Haiman CA;Wan P;Chen GK;Le Marchand L;Kolonel LN;Henderson BE;Fujioka T;Habuchi T;Nakamura Y;Ogawa O;Nakagawa H
• 通讯作者: Nakagawa H

NKX3.1遺伝子領域内の単塩基多型はNKX3.1の発現量を低下させることで前立腺癌易罹患性に関与する

NKX3.1 基因区域内的单核苷酸多态性通过降低 NKX3.1 的表达水平与前列腺癌易感性相关

• 发表时间: 2011
• 作者: Akamateu S;Takata R;Kamatani N;Fujioka T;Ogawa O;Kubo M;Nakamura Y;Nakagawa H.;赤松秀輔;赤松秀輔;赤松秀輔;赤松秀輔;赤松秀輔;赤松秀輔;赤松秀輔;赤松秀輔;赤松秀輔;赤松秀輔
• 通讯作者: 赤松秀輔