大腸菌におけるRNase Eを基盤としたRNA分解複合体の解析

大肠杆菌中基于 RNase E 的 RNA 降解复合物的分析

• 批准号: 10J05285
• 负责人: 池田 幸樹
• 金额: $ 0.9万
• 依托单位: Keio University (2011)Nagoya University (2010)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10J05285/
• 关键词: RNase E; Hfq; FAU-1; processing; ribosomal RNA; Pyrococcus furiosus; sRNA

近年、Bacteriaではストレスに応答して様々なsmall RNA(sRNA)が発現し、転写後制御を行うことがわかってきた。大腸菌においてRNase EはRNA分解及びRNAプロセシングに関わる主要なRNaseである。また、HfqはRNAシャペロンであり、RNase Eと相互作用する。この相互作用は、small RNAが標的とするmRNAの速やかな分解において重要である。しかし、RNase EとHfq間の相互作用領域については未解明であった。私はRNase EのC末端欠失変異株を用いた解析により、RNase E/Hfq間の相互作用領域を明らかにした。この研究成果を原著論文として国際専門誌に発表した(Ikeda et al.,2011)。また、RNase Eに類似したタンパク質として、超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosus(P.furiosus)においてFAU-1タンパク質が報告されている(Kanai et al.,2003)。このFAU-1遺伝子は多くの古細菌に保存されているが、未だその活性と役割については明らかになっていない。そこで本年度はArchaeaであるP.furiosusを用いてFAU-1タンパク質の機能の同定を試みた。結果として、FAU-1タンパク質の精製画分はin vitro転写されたP.furiosusの5S ribosomal RNA(rRNA)前駆体の分解を促進することがわかった。Archaeaにおいて、rRNA前駆体の成熟化機構については詳細に明らかにされていない。前述の結果より、FAU-1タンパク質はrRNA前駆体の成熟化に関わるRNaseであることが期待される。FAU-1タンパク質の解析は生物に必須であるリボソームの生合成経路を明らかにする可能性があり、研究を継続することは非常に重要である。

In recent years, the small RNA (sRNA) has been reported in recent years. In recent years, the financial situation has been greatly improved. The RNase E RNA was decomposed and the main RNase was broken down by RNA fungus. Hfq, RNA interaction, RNase E interaction. Interaction, small RNA interaction, mRNA speed decomposition, important interaction. The field of interaction between RNase E and Hfq is unknown. Private RNase E C-terminal deletion strains were used to analyze the field of interaction and RNase E/Hfq interaction. The original book "Research results" (Ikeda et al.,2011) is based on the national journal. The RNase E type is similar to the FAU-1 report (Kanai et al.,2003), which is similar to that of the FAU-1 report (Kanai et al.,2003). There are many kinds of bacteria in the FAU-1. They are saved, and the active ones are not. This year, the Archaea will use the same FAU-1 testing mechanism as the P.furiosus. Results the results showed that in vitro was used to P.furiosus the 5S ribosomal RNA (rRNA) in order to promote the decomposition of the body. The Archaea system, the rRNA predecessor system, and the maturity mechanism of the pre-rRNA system have made it clear that they are responsible for the development of the system. The aforementioned results and FAU-1 results show that the rRNA precursor matured, and the RNase precursors are looking forward to it. It is necessary for FAU-1 to analyze the importance of biosynthesis. It is very important to study the possibility of biological synthesis.

项目成果

超好熱性アーキアPyrococcus furiosusにおけるRNase様タンパク質FAU-1の機能解析

超嗜热古菌激烈热球菌中RNase样蛋白FAU-1的功能分析

• 发表时间: 2011
• 作者: Yoshiki Ikeda;Mieko Yagi;Teppei Morita;Hiroji Aiba;Yoshiki Ikeda;Yoshiki Ikeda;Yoshiki Ikeda
• 通讯作者: Yoshiki Ikeda

Identification of Hfq binding sites on RNase E in E. coli.

大肠杆菌中 RNase E 上 Hfq 结合位点的鉴定。

• 发表时间: 2011
• 作者: 池田幸樹;八木美江子;森田鉄兵;金井昭夫;饗場弘二
• 通讯作者: 饗場弘二

Research of RNase E-G family proteins

RNase E-G家族蛋白的研究

• 发表时间: 2011
• 作者: Yoshiki Ikeda;Mieko Yagi;Teppei Morita;Hiroji Aiba;Yoshiki Ikeda
• 通讯作者: Yoshiki Ikeda

Hfq binding at RhlB-recognition region of RNase E is crucial for the rapid degradation of target mRNAs mediated by sRNAs in Escherichia coli

• DOI: 10.1111/j.1365-2958.2010.07454.x
• 发表时间: 2011-01-01
• 期刊: MOLECULAR MICROBIOLOGY
• 影响因子: 3.6
• 作者: Ikeda, Yoshiki;Yagi, Mieko;Aiba, Hiroji
• 通讯作者: Aiba, Hiroji

Analysis of Archaeal RNase E-like protein, FAU-1 in Pyrococcus furiosus

激烈火球菌中古菌 RNase E 样蛋白 FAU-1 的分析

• 发表时间: 2011
• 作者: Yoshiki Ikeda;Mieko Yagi;Teppei Morita;Hiroji Aiba;Yoshiki Ikeda;Yoshiki Ikeda;Yoshiki Ikeda;Yoshiki Ikeda
• 通讯作者: Yoshiki Ikeda