大腸菌におけるRNase Eを基盤としたRNA分解複合体の解析

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近年、Bacteriaではストレスに応答して様々なsmall RNA(sRNA)が発現し、転写後制御を行うことがわかってきた。大腸菌においてRNase EはRNA分解及びRNAプロセシングに関わる主要なRNaseである。また、HfqはRNAシャペロンであり、RNase Eと相互作用する。この相互作用は、small RNAが標的とするmRNAの速やかな分解において重要である。しかし、RNase EとHfq間の相互作用領域については未解明であった。私はRNase EのC末端欠失変異株を用いた解析により、RNase E/Hfq間の相互作用領域を明らかにした。この研究成果を原著論文として国際専門誌に発表した(Ikeda et al.,2011)。また、RNase Eに類似したタンパク質として、超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosus(P.furiosus)においてFAU-1タンパク質が報告されている(Kanai et al.,2003)。このFAU-1遺伝子は多くの古細菌に保存されているが、未だその活性と役割については明らかになっていない。そこで本年度はArchaeaであるP.furiosusを用いてFAU-1タンパク質の機能の同定を試みた。結果として、FAU-1タンパク質の精製画分はin vitro転写されたP.furiosusの5S ribosomal RNA(rRNA)前駆体の分解を促進することがわかった。Archaeaにおいて、rRNA前駆体の成熟化機構については詳細に明らかにされていない。前述の結果より、FAU-1タンパク質はrRNA前駆体の成熟化に関わるRNaseであることが期待される。FAU-1タンパク質の解析は生物に必須であるリボソームの生合成経路を明らかにする可能性があり、研究を継続することは非常に重要である。