ヒト遺伝的多型の生体機能解析実験系の構築―メダカをモデルとした新たなアプローチ
人类基因多态性生物功能分析实验体系的构建——以青鳉为模型的新方法
基本信息
- 批准号:10J06207
- 负责人:
- 金额:$ 0.9万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2010
- 资助国家:日本
- 起止时间:2010 至 2011
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
【背景】近年ヒト集団において膨大な量のゲノムワイドな遺伝的多型データが蓄積されているが、それらの対立遺伝子(アレル)がどのような表現型に影響するかの機能解析を行う有効な実験系がない。【目的】メダカ集団をヒト集団のアナロジーとして捉え、ヒトでアレル間での機能差が知られているcytochrome P450(CYP)遺伝子に着目し、メダカを用いたヒト多型のアレル間の機能差を推定する実験系を構築する。【平成23年度の成果】1、平成22年度にサンプリングした南日本グループの野生メダカDNAサンプル(青森94個体、岩手149個体、茨城173個体、千葉124個体、岡山95個体、広島96個体、佐賀96個体、沖縄149個体の計976個体)を用いて、ミトコンドリアDNA・D-loop領域の塩基配列解析を行い、南日本グループの遺伝的多様性が北部九州(佐賀)を起源とする可能性を示した(Katsmura et al. 2012)。2、メダカ地域集団に見られたCYPアレルの酵素活性を、GAL4-UASシステムを用いた培養細胞発現系により測定した。ヒトCYPアレル間で酵素活性差が見られる基質を用いたところ、メダカのCYPアレル間でも有意な酵素活性差が観察された。3、有意な酵素活性差を示したアレルを持つ地域集団の生体を用いて、CYPが代謝する基質を使い薬剤暴露実験を行った。その結果、上記の2によって示された酵素活性が異なるアレルを持つ地域集団間で、薬剤暴露後の行動に違いが見られる可能性が示唆された。
[Background] In recent years, the number of clusters has increased, and the number of clusters has increased. The number of clusters has increased, and the number of clusters has increased. [Objective] To construct a system for estimating the functional differences between cytochrome P450(CYP) genes in different groups. 1. In 2012, the Japanese government launched a campaign to promote the development of wild DNA in Japan.(94 individuals in Aomori, 149 individuals in Iwate, 173 individuals in Ibaraki, 124 individuals in Chiba, 95 individuals in Okayama, 96 individuals in Hiroshima, 96 individuals in Saga, and 149 individuals in Oki) The diversity of southern Japan's cultural heritage and the possibility of its origin in northern Kyushu (Saga) are shown (Katsmura et al. 2012). 2. The enzyme activity of CYP and GAL4-UAS in cultured cells was determined by the method of cell culture. The difference in CYP activity between the two groups was observed in the matrix. 3. Intentional enzyme activity difference indicates that the enzyme is not exposed to the substrate of CYP metabolism and that the enzyme is not exposed to the substrate. The results of the above two tests indicate that enzyme activity varies between regions, and that activity after drug exposure may vary.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A population genetic study on the relationship between medaka fish and the spread of wet-rice cultivation across the Japanese archipelago
青鳉鱼与日本列岛湿稻种植传播关系的群体遗传学研究
- DOI:10.1537/ase.110525
- 发表时间:2012
- 期刊:
- 影响因子:0.7
- 作者:Katsumura;T.;Oda;S.;Tsukamoto;K.;Sekiya;Y.;Yamashita;T.;Aso;M.;Hata;M.;Nonaka;M.;Mano;S.;Ishida;H.;Mitani;H.;Kawamura;S.;Oota;H.
- 通讯作者:H.
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- DOI:
- 发表时间:2011
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:T. Katsumura;S. Oda;H. Mitani;S. Kawamura;H. Oota
- 通讯作者:H. Oota
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- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Katsumura;T.;Oda;S.;Mitani;H.;Kawamura;S.;Oota;H.
- 通讯作者:H.
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- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:勝村啓史;尾田正二;三谷宏志;河村正二;太田博樹
- 通讯作者:太田博樹
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