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初成土壌形成に関わる微生物生態系の解析

参与原生土壤形成的微生物生态系统分析

基本信息

批准号：
10J07638
负责人：
藤村玲子
金额：
$ 0.9万
依托单位：
Tokyo University of Agriculture and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2011
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10J07638/
关键词：
初成土壌微生物生態系三宅島2000年噴火ゲノム解析

项目摘要

本年度は1.初成土壌より分離された細菌、Leptospirillum ferrooxidans C2-3株のゲノム解析および、2.三宅島2000年噴火火山灰堆積物のメタゲノム解析を行った。1.Leptospirillum ferrooxidans C2-3株のゲノム解析前年度に行った一次アノテーションの結果を元に二次アノテーションを行った結果、L.ferrooxidans C2-3株の炭素固定経路はカルビンベンソン回路ではなく還元的TCA回路を利用している可能性を明らかにした。本結果は難培養微生物であるLeptospirillum属細菌の特徴を知る上で重要な情報を提供したといえる。2.三宅島2000年噴火火山灰堆積物のメタゲノム解析堆積年齢3.5、6.6、9.5年の火山灰堆積物より抽出したDNAをパイロシークエンス解析した結果に対し、バイオインフォマティクス処理を行った。本項の塩基配列決定に係る解析は、指導教員である東京農工大学太田寛行教授及び東京大学服部正平教授により進められた。得られた全塩基配列を用いて研究協力者(服部教授)の指導の下、東京大学柏キャンパスにて解析の一部を行った。また、本解析では1.で得られた情報をデータベースとして利用した。解析の結果、噴火堆積後3.5、6.6、9.5年の間で鉄酸化細菌を始めとする初成土壌微生物群集が遷移したことが明らかにされた。また、炭素固定、窒素固定に寄与する主要な微生物群も変化することが明らかにされた。本研究成果は土壌生成機構の解明で重要な知見となることが期待される。

This year, we conducted the following analysis: 1. bacteria isolated from the primary soil, Leptospirum ferrooxidans C2-3 strain, 2. analysis of volcanic ash deposits from Miyake Island 2000. 1. Leptospirum ferrooxidans C2-3 strain was analyzed for the first time in the previous year. The results of the second time in the previous year showed that the carbon fixation circuit of L.ferrooxidans C2-3 strain was more likely to be utilized in the TCA circuit. The results provide important information for understanding the characteristics of Leptospirum bacteria, which are difficult to culture. 2. Analysis of volcanic ash deposits from Miyake Island in 2000: 3.5, 6.6 and 9.5 years old The decision on the allocation of this item was made by Professor Hiroyuki Ohta of Tokyo University of Agriculture and Technology and Professor Masahiro Hattori of Tokyo University. A part of the research team (Professor Hattori) who conducted the research on the overall structure of the foundation was invited to participate in the research. This analysis is based on the following: The results showed that ferro acidifying bacteria began to migrate 3.5, 6.6 and 9.5 years after the explosion. The main microbiota of carbon fixation, carbon fixation and nitrogen fixation are characterized by light and light. The results of this study are important for understanding the mechanism of soil formation.