初成土壌形成に関わる微生物生態系の解析
初成土壌形成に関わる微生物生態系の解析
批准号:
10J07638
负责人:
藤村 玲子
金额:
$0.9万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2010
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2010 至 2011
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英文摘要
本年度は1.初成土壌より分離された細菌、Leptospirillum ferrooxidans C2-3株のゲノム解析および、2.三宅島2000年噴火火山灰堆積物のメタゲノム解析を行った。1.Leptospirillum ferrooxidans C2-3株のゲノム解析前年度に行った一次アノテーションの結果を元に二次アノテーションを行った結果、L.ferrooxidans C2-3株の炭素固定経路はカルビンベンソン回路ではなく還元的TCA回路を利用している可能性を明らかにした。本結果は難培養微生物であるLeptospirillum属細菌の特徴を知る上で重要な情報を提供したといえる。2.三宅島2000年噴火火山灰堆積物のメタゲノム解析堆積年齢3.5、6.6、9.5年の火山灰堆積物より抽出したDNAをパイロシークエンス解析した結果に対し、バイオインフォマティクス処理を行った。本項の塩基配列決定に係る解析は、指導教員である東京農工大学太田寛行教授及び東京大学服部正平教授により進められた。得られた全塩基配列を用いて研究協力者(服部教授)の指導の下、東京大学柏キャンパスにて解析の一部を行った。また、本解析では1.で得られた情報をデータベースとして利用した。解析の結果、噴火堆積後3.5、6.6、9.5年の間で鉄酸化細菌を始めとする初成土壌微生物群集が遷移したことが明らかにされた。また、炭素固定、窒素固定に寄与する主要な微生物群も変化することが明らかにされた。本研究成果は土壌生成機構の解明で重要な知見となることが期待される。
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Metagenomic analysis of microbial succession on fresh volcanic ash deposits in the Island of Miyake, Japan
日本三宅岛新鲜火山灰沉积物微生物演替的宏基因组分析
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takanori Sugiyama, Peter S. Turner, Mio Murao, 藤村玲子, 藤村玲子]
通讯作者:
藤村玲子
三宅島2000年噴火火山灰堆積物から分離された鉄酸化細菌Leptospirillum ferrooxidans C2-3株のゲノム解析
氧化亚铁钩端螺旋菌菌株 C2-3 的基因组分析,这是一种从 2000 年三宅岛喷发的火山灰沉积物中分离出来的铁氧化细菌
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kajikawa, T., 藤村玲子, 藤村玲子, 藤村玲子]
通讯作者:
藤村玲子
三宅島2000年噴火火山灰堆積物おける初成土壌微生物生態系のメタゲノム解析
2000年三宅岛喷发火山灰沉积物中原生土壤微生物生态系统的宏基因组分析
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takanori Sugiyama, Peter S. Turner, Mio Murao, 藤村玲子]
通讯作者:
藤村玲子
初成土壌環境における微生物-三宅島土壌生態系再生のメカニズムを探る
原生土壤环境中的微生物——探索三宅岛土壤生态系统再生机制
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
日本生態学会誌
影响因子:
--
作者:
[Kajikawa, T., 藤村玲子, 藤村玲子]
通讯作者:
藤村玲子
Nitrogen fixation by iron-oxidizing bacteria during early ecosystem development on Miyake-jima, Japan volcanic deposits
日本三宅岛火山沉积物早期生态系统发育过程中铁氧化细菌的固氮作用
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takanori Sugiyama, Peter S. Turner, Mio Murao, 藤村玲子]
通讯作者:
藤村玲子
非光合成窒素固定微生物群の水田土壌における時空間分布と寄与率の解明
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批准号:18K18177
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$2.75万
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财政年份:2018
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负责人:藤村 玲子
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依托单位:
海外基金