翻訳合成中の特殊ペプチドの環化を指標とするリボソームトンネルの構造解析

以翻译合成过程中特殊肽环化为指标的核糖体隧道结构分析

• 批准号: 10J09695
• 负责人: 岩崎 一浩
• 金额: $ 0.9万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10J09695/
• 关键词: 翻訳合成; 遺伝暗号リプログラミング; リボソームトンネル; 特殊ペプチド; チオエーテル結合; クロロアセチル基; ペプチドの環状化; 質量分析; 遺伝暗号リブログラミング

EpCAMに結合するペプチドを用いた癌細胞の標識を行った。抗体では染色できない過密状態の癌細胞でもペプチドはよく浸潤して染色できることを示し、癌細胞の塊を効率的に染色する新たな道具として、有用であることがわかった。より戦略的に細胞死を誘導し、癌を抑制する手法として、lyticペプチドという細胞毒性のあるペプチド配列を、セレクションで得られたペプチドに付加した。その結果、EpCAM依存的な癌細胞の細胞死の誘導が観察され、癌の治療に応用できる可能性を示した。また、ペプチドの環状化の選択性に関する研究を行い、論文を投稿した。ペプチド中にCys残基が二つある場合、ClAc基はいずれかのCys残基と反応したチオエーテル結合およびジスルフィド結合の三種類の結合形成の可能性が考えられる。このようなペプチドの結合形成の選択性を調べるため、モデルペプチドを調製し解析した。その結果、Cys残基が二番目で^<ClAc>Pheに隣接する場合を除き、N末端側のCys残基が選択的に反応してチオエーテル結合を形成することがわかった。二番目のCys残基は隣接する^<ClAc>Pheとは反応できず、C末端側のCys残基と反応することがわかった。さらに、^<ClAc>Pheと三つのCys残基を含むモデルペプチドを調製し、この法則がチオエーテル結合とジスルフィド結合からなる二環ペプチドにも応用できることを示し、この結合形成の選択性がペプチドの配列や長さに依存しないことから、二環ペプチドライブラリーの調製により、新たな創薬シーズが得られる可能性を示した。この結果は、今後セレクションで得られる様々なペプチドにおいて、二つ以上のCys残基が含まれる場合、結合形成を予測する上で、非常に有用な知見となる。また、チオエーテル結合とジスルフィド結合からなる二環ペプチドのセレクションへの応用が期待される。

EpCAMに in combination with するペプチドを uses に た cancer cell <s:1> to mark を rows った. Antibody で は dyeing で き な い overcrowded state の cancer で も ペ プ チ ド は よ く infiltrating し て dyeing で き る こ と を し, cancer cells の block を sharper rate に dyeing す る new た な props と し て, useful で あ る こ と が わ か っ た. よ り 戦 slightly the に を induced cell death を し, cancer inhibition す る gimmick と し て, lytic ペ プ チ ド と い う cytotoxicity の あ る ペ プ チ ド column を, セ レ ク シ ョ ン で have ら れ た ペ プ チ ド に plus し た. そ の results, EpCAM dependent な cancer の induced cell death の が 観 examine さ の れ, cancer treatment に 応 with で き を る possibility in し た. Youdaoplaceholder0, ペプチド, ペプチド, ring-shaped <s:1>, select 択 に related する research を field を, and submit the paper を to た た. ペ プ チ ド に of Cys residue が two つ あ る occasions, ClAc は い ず れ か の Cys residue と anti 応 し た チ オ エ ー テ ル combining お よ び ジ ス ル フ ィ ド combined with three kinds の の が exam form の possibility え ら れ る. The combination of <s:1> ようなペプチド ようなペプチド forms <s:1> selective 択 を modulation べるため and モデ ペプチドを ペプチドを modulation <s:1> analysis た. そ の results, Cys residue が second leg mesh で ^ < ClAc > Phe に 隣 meet す を except き る occasions, N terminal side の Cys residue が sentaku に reverse 応 し て チ オ エ ー テ ル combined を form す る こ と が わ か っ た. Second leg mesh の Cys residue は 隣 meet す る ^ < ClAc > Phe と は anti 応 で き ず, C terminal side の Cys residue と anti 応 す る こ と が わ か っ た. さ ら に, ^ < ClAc > Phe と three つ の Cys residue を containing む モ デ ル ペ プ チ ド を modulation し, こ の law が チ オ エ ー テ ル combining と ジ ス ル フ ィ ド combining か ら な る bicyclic ペ プ チ ド に も 応 with で き る こ と を し, こ の form の sentaku sex が ペ プ チ ド の with long column や さ に dependent し な い こ と か ら, ペ プ チ ド ラ イ ブ ラ リ ー の modulation に よ り, new た な gen 薬 シ ー ズ が have ら れ を る possibility in し た. は こ の results, future セ レ ク シ ョ ン で have ら れ る others 々 な ペ プ チ ド に お い て, more than two つ の Cys residue が containing ま れ る occasions, form を to measure す る で, very useful に な knowledge と な る. ま た, チ オ エ ー テ ル combining と ジ ス ル フ ィ ド combining か ら な る bicyclic ペ プ チ ド の セ レ ク シ ョ ン へ の 応 with が expect さ れ る.

项目成果

Carcinomas cell imaging with an anti-EpCAM thioether macrocyclic peptide uncovered by RaPID system

使用 RaPID 系统发现的抗 EpCAM 硫醚大环肽进行癌细胞成像

• 发表时间: 2011
• 作者: Kazuhiro Iwasaki;Takayuki Katoh;Hiroaki Suga
• 通讯作者: Hiroaki Suga

In vitro Selection of the EpCAM Inhibitor from the Cyclic Peptide Library by means of the mRNA Display Method

通过 mRNA 展示方法从环肽库中体外筛选 EpCAM 抑制剂

• 发表时间: 2010
• 作者: Kazuhiro Iwasaki;Takayuki Katoh;Hiroaki Suga;N. Kobayashi;Koetsu Kon;岩崎一浩
• 通讯作者: 岩崎一浩

Ribosomal Synthesis of Lantibiotics-like Cyclic Peptides via Thermal Isomerization of Vinylglycine

通过乙烯基甘氨酸的热异构化核糖体合成羊毛硫抗生素类环肽

• 发表时间: 2010
• 作者: Kazuhiro Iwasaki;Takayuki Katoh;Hiroaki Suga;N. Kobayashi;Koetsu Kon;岩崎一浩;N. Kobayashi;Kon Koetsu;岩崎一浩;小林信之;今孝悦;岩崎一浩;小林信之;岩崎一浩;山田秀秋;岩崎一浩;星野勧宏;岩崎一浩
• 通讯作者: 岩崎一浩

Carcinomas Cell Imaging by Using EpCAM-binding Peptides Selected from the Cyclic Non-standard Peptide Library

使用选自环状非标准肽库的 EpCAM 结合肽进行癌细胞成像

• 发表时间: 2010
• 作者: Kazuhiro Iwasaki;Takayuki Katoh;Hiroaki Suga;N. Kobayashi;Koetsu Kon;岩崎一浩;N. Kobayashi;Kon Koetsu;岩崎一浩
• 通讯作者: 岩崎一浩

Evaluation of the Binding Affinity of the EpCAM Inhibitor Selected by the mRNA Display from the Cyclic Peptide Library

通过 mRNA 显示从环肽库中选择的 EpCAM 抑制剂的结合亲和力评估

• 发表时间: 2010
• 作者: Kazuhiro Iwasaki;Takayuki Katoh;Hiroaki Suga;N. Kobayashi;Koetsu Kon;岩崎一浩;N. Kobayashi;Kon Koetsu;岩崎一浩;小林信之;今孝悦;岩崎一浩;小林信之;岩崎一浩
• 通讯作者: 岩崎一浩