高浄化効率を誘導する異種微生物間ネットワーク構造の解明

阐明不同微生物之间的网络结构，从而提高净化效率

• 批准号: 21651029
• 负责人: 二又 裕之
• 金额: $ 2.05万
• 依托单位: Shizuoka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21651029/
• 关键词: 微生物生態系; 細菌群集構造の変遷; 連続集積培養; バイオレメディエーション; 複雑系; 数理生物学

今年度の研究では、新たな3菌株Pseudomonas sp.C8株、Ralstonia sp.P-10株およびComamonas testosterone R2株の異属3菌株の混合連続集積培養系を構築し、その系全体の機能をフェノールおよびカテコールに対する動力学的パラメーターを測定することにより評価し、供試菌株の挙動をフェノールヒドロキシレースをコードする遺伝子を標的としたreal-time PCR法により解析した。混合培養当初、C8株が優占したものの3菌株の菌密度はほぼ同等であった。しかし、動力学的パラメーターから判断すると、フェノールおよびカテコール分解をR2株が担っていたと推察された。これら安定した混合系に撹乱を与えるために、炭素源(フェノール)の供給を止めることで飢餓状態とし(約10日間)、その後再びフェノールの供給を開始した。その結果、フェノールの再添加によってフェノールおよびカテコールに対する動力学的パラメーターが大きく変動し、最終的にC8株のそれらと一致した。この結果から、システム全体は飢餓状態後のフェノールに負荷に対して柔軟に対応した一方で、その内部ではその機能的役割を変化させていたことが示唆された。その後更なる培養を実施したところ、P-10株の菌密度が徐々に減少し(10^5～10^6 cells mL^<-1>)、C8株とR2株がほぼ同密度で優占化した。その一方で、動力学的解析から、フェノールはC8株が、カテコールはR2株が担っている事が示唆された。現在、供試菌株のゲノム解析を進行させており、今後、本実験で得られた変遷機構について、INAあるいはタンパクレベルで解析し、そのメカニズムを明らかにしていく予定である。

This year, <s:1> research で で, new たな3 strains Pseudomonas sp.C8 and Ralstonia sp.P-10 およびComamonas testosterone R2 の different strains belong to 3 strains の 続 set mixed together into an integrated cultivation を build し, そ の is all の function を フ ェ ノ ー ル お よ び カ テ コ ー ル に す seaborne る dynamics パ ラ メ ー タ ー を determination す る こ と に よ り review 価 し, strains の 挙 dynamic を フ ェ ノ ー ル ヒ ド ロ キ シ レ ー ス を コ ー ド す る heritage 伝 を son mark と し た real - time PCR method によ によ parse た. In the initial stage of mixed culture, the C8 strain が had an advantage over the <s:1> た た た が of the three strains, and the <s:1> bacterial density ほぼ ほぼ was the same as that of the three strains であった. し か し, dynamics of パ ラ メ ー タ ー か ら judgment す る と, フ ェ ノ ー ル お よ び カ テ コ ー ル decomposition を R2 strains が bear っ て い た と push examine さ れ た. こ れ ら settle し た hybrid system に 撹 disorderly を and え る た め に, carbon source (フ ェ ノ ー ル) の supply を check め る こ と で hungry と し (10) in the day, そ の び again after フ ェ ノ ー ル の supply を began し た. そ の results, フ ェ ノ ー ル の add に よ っ て フ ェ ノ ー ル お よ び カ テ コ ー ル に す seaborne る dynamics パ ラ メ ー タ ー が big き く - し, final に C8 strains の そ れ ら と consistent し た. こ の results か ら, シ ス テ ム all は hungry after の フ ェ ノ ー ル に load に し seaborne て soft に 応 seaborne し た で, そ の internal で は そ cut を の function of the service - the さ せ て い た こ と が in stopping さ れ た. そ の after more な る cultivate を be applied し た と こ ろ, density of P - 10 strains の が xu 々 に reduce し (10 ^ 5 ~ 10 ^ 6 cells mL ^ < - > 1), C8 seedlings が と R2 ほ ぼ with density で best accounts for the し た. で そ の party, dynamics analytical か ら, フ ェ ノ ー ル は C8 plant が, カ テ コ ー ル は R2 strains が bear っ て い る matter が in stopping さ れ た. Now, all strains の ゲ ノ ム parsing を for さ せ て お り, in the future, this be 験 で have ら れ た - moving agency に つ い て, INA あ る い は タ ン パ ク レ ベ ル で analytical し, そ の メ カ ニ ズ ム を Ming ら か に し て い く designated で あ る.

项目成果

Relationship between reductive-dehalogenase-homologous genes transcriptional level and dechlorinating activity in "Dehalococcoides"-containing tetrachloroethene-dechlorinating enrichment culture TUT2264.

含“Dehalococcoides”四氯乙烯脱氯富集培养物TUT2264中还原脱卤酶同源基因转录水平与脱氯活性的关系。

• 发表时间: 2009
• 期刊: Microbes and Environ 24
• 作者: Futamata;H.;S. Kaiya;M. Sugawara;A. Hiraishi
• 通讯作者: A. Hiraishi

微生物生態系の動的変化と細菌間相互作用

微生物生态系统和细菌相互作用的动态变化

• 发表时间: 2009
• 作者: 水川薫子;小林淳;木下今日子;桜井健郎;高田秀重;鈴木規之;二又裕之
• 通讯作者: 二又裕之

連続集積培養系における Variovorax 属細菌の優占化と細菌間相互作用

连续富集培养系统中 Variovorax 细菌的优势和细菌与细菌的相互作用

• 发表时间: 2009
• 作者: 平井英貴;瀬野淳;二又裕之
• 通讯作者: 二又裕之

微生物生態系における動的安定機構を探る

探索微生物生态系统的动态稳定机制

• 发表时间: 2010
• 作者: 新海正;金子孝夫;佐々木徹;田原正一;野本茂樹;野本恵美;倉本和直;近藤昊;二又裕之
• 通讯作者: 二又裕之

連続集積混合培養系における細菌群集の変遷と菌株間相互作用の解析

连续混合培养系统中细菌群落变化和菌株间相互作用分析

• 发表时间: 2009
• 作者: Yohei AKUTSU;Dong-Yeol Lee;Yu-You LI;瀬野淳
• 通讯作者: 瀬野淳