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コアコレクションを利用したソルガムのアレロパシー活性に関与する染色体領域の特定

使用核心种质鉴定参与高粱化感活性的染色体区域

基本信息

批准号：
21658002
负责人：
奥野員敏
金额：
$ 2.05万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2009
资助国家：
日本
起止时间：
2009 至 2010
项目状态：
已结题

项目摘要

ソルガムの起源地であるアフリカでは、除草剤による雑草防除は現実的でなく、アレロパシー活性(他感作用)を利用した雑草防除は有効な手段となる。そこで、本課題では、ソルガムのアレロパシー活性の品種変異を解析し、関連するQTLの検出をめざす。(1)SSRマーカーによる多型解析SSRマーカーによるコアコレクションの多型解析の結果、10本の染色体で合計98座のSSRマーカー座から連鎖地図を作製した。(2)アソシエーション解析によるQTLの検出107品種のアレロパシー活性値とSSRマーカー98座におけるDNA遺伝子型情報を用いて解析した結果、第2および第5染色体上に高い関連性を示す領域を検出した。レタス根の伸長阻害効果を指標としてアレロパシー活性を評価すると、少なくとも3ケ所の関連領域(QTL)が存在すると考えられる。(3)QTL解析今年度、F_2200個体を圃場で栽培し、個体別に葉サンプルを採取しDNAを抽出した。両親品種で多型を示すSSRマーカーを選定し、連鎖地図を作製した。F2個体別に自殖F3種子を採取した。現在、F3系統を用いてアレロパシー活性を評価中である。評価終了後に、SSRマーカー遺伝子型情報と併せてQTL解析を行って、アレロパシー活性関連QTLを検出する。

The origin of ソルガムのであるアフリカでは, the weed killer による雑草control は the current でなく, アレロパシーActivity (histological effect) is an effective means of controlling した鑑草 and となる.そこで, this topic では, ソルガムのアレロパシーactive variety difference をanalysis し, related するQTL の検出をめざす. (1)SSR Maritime Polytype Analysis SSR Maritime Polytype Analysis As a result of the analysis, a total of 98 SSR chromosomes in 10 chromosomes were linked to each other and were produced. (2) Analytical analysis of QTL of 107 varieties of アソシエーションのアレロパシーactive とSSR マーカー98 におThe DNA genetic information is analyzed using the results, and the high correlation level on the 2nd and 5th chromosome is shown in the field. Evaluation of the elongation-inhibiting effect of レタスススのをとしてアレロパシーactivity を価すると, there is no relevant field (QTL) in 3ケなくとも3ケケがするとtestえられる. (3) QTL analysis This year, F_2200 individuals were cultivated in the nursery, and individual DNA was collected and extracted from individual leaves. We have many types of products, including selected SSR products and chain production. F2 individuals can self-produce F3 seeds by harvesting them. Now, the F3 system is using the active version of the system. After the evaluation is completed, the SSR malfunctioning QTL analysis and QTL analysis are carried out, and the active related QTL is revealed.