The ubiquitin-like modifier FAT10 in autophagosomal targeting

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Die kovalente Bindung von ubiquitin-ähnlichen Modifikatoren an Proteine kann deren Funktion und Lokalisierung in der Zelle maßgeblich bestimmen. Bei diesen Bindungen handelt es sich um Isopeptidbindungen, die durch Enzymkaskaden spezifisch geknüpft werden. Ein neues Beispiel für so einen Modifikator ist das Protein FAT10, welches aus zwei ubiquitin-ähnlichen Domänen besteht. Das fat10 Gen ist im Hauptgewebeverträglichkeits-Komplex kodiert und wird synergistisch durch Interferon-gamma und Tumornekrosefaktor-alpha induziert. Kürzlich konnten wir zeigen, dass FAT10 an bisher unbekannte Proteine konjugiert wird, und dass die Überexpression von FAT10 den apoptotischen Zelltod induziert. In diesem Projekt wollen wir die Zielproteine der FAT10-Konjugation durch Aufreinigung der Konjugate und massenspektrometrische Analyse identifizieren. Die FAT10-konjugieren- den Enzyme sollen ebenfalls durch biochemische Reinigung oder alternativ durch two-hybrid Analyse identifiziert werden. Die Identifikation der Zielproteine und Enzyme der FAT10 Konjugation könnte uns helfen, die Apoptoseinduktion durch Zytokine besser zu verstehen, welche die Immunantwort und somit die Abwehr gegen Infektionen und Tumore steuert.