Multiple testing theory for systematic analysis of meta genes and its applications

元基因系统分析的多重检验理论及其应用

• 批准号: 21700313
• 负责人: YOSHIDA Ryo
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: The Institute of Statistical Mathematics
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21700313/
• 关键词: バイオインフォマティクス; 多重検定; メタ遺伝子; トランスクリプトーム; バイオマーカー探索; メタアナリシス; ソフトウェア; 遺伝子発現; ソフトウエア

This research project aims to develop statistical testing theory and integrated analytic tools for analyzing massively-collected information on cellular regulatory programs, called 'omics data', involving genomics, transcriptomics, proteomics, and metabolomics. Specifically, the newly-derived methods enable us to identify key regulatory units of genes characterizing molecular basis of different cellular phenotypes, such as tumor cells demonstrating sensitivity or resistance to anticancer drugs.

本研究项目旨在开发统计检验理论和综合分析工具，用于分析大量收集的细胞调控程序信息，称为“组学数据”，涉及基因组学，转录组学，蛋白质组学和代谢组学。具体而言，新衍生的方法使我们能够识别表征不同细胞表型的分子基础的基因的关键调控单元，例如对抗癌药物表现出敏感性或抗性的肿瘤细胞。

项目成果

グラフィカルファクターモデルと事後エントロピーにもとづく決定論的アニーリング:システムズバイオロジーへの応用

基于图形因子模型和后验熵的确定性退火：在系统生物学中的应用

• 发表时间: 2010
• 作者: T. Inazumi;S. Shimizu and T. Washio;吉田亮;吉田亮
• 通讯作者: 吉田亮

遺伝子発現時系列データおよびバイオデータベース情報を基にした活性/抑制型転写因子の同定

基于基因表达时间序列数据和生物数据库信息识别活性/抑制性转录因子

• 发表时间: 2010
• 作者: 長尾大道;吉田亮;斎藤正也;樋口知之;長崎正朗;井元清哉;山口類;宮野悟;山内麻衣;後藤典子
• 通讯作者: 後藤典子

Bayesian experts in exploring reaction kinetics of transcription circuits

贝叶斯专家探索转录回路的反应动力学

• 发表时间: 2010
• 期刊: Bioinformatics 26(18)
• 作者: R.Yoshida;M.Saito;H.Nagao;T.Higuchi
• 通讯作者: T.Higuchi

Life Science Data Assimilation Systems : 生化学反応系の複雑性とその克服へ向けて

生命科学数据同化系统：生化反应系统的复杂性以及如何克服它们

• 发表时间: 2010
• 作者: 稲積孝紀;鷲尾隆;清水昌平;鈴木譲;山本章博;河原吉伸;吉田亮
• 通讯作者: 吉田亮

Bayesian Learning in Sparse Graphical Factor Models via Variational Mean-Field Annealing

• DOI: 10.5555/1756006.1859910
• 发表时间: 2010-03
• 期刊: Journal of machine learning research : JMLR
• 作者: Ryo Yoshida;M. West