Global extractionand analysis of protein tertiary structure patterns
Global extractionand analysis of protein tertiary structure patterns
蛋白质三级结构模式的整体提取和分析
批准号：
21700323
负责人：
HAYASHIDA Morihiro
金额：
$2.0万
依托单位：
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2009
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2009 至 2012
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英文摘要
We developed a graph compression method that does not depend on implementation, and proposed a similarity measure between graphs. We regarded a distance matrix between Cαatoms of a protein as an image, and proposed a grammar-based image compression method. In addition, we proposed a grammar-based tree compression method. Furthermore, we developed prediction methods using protein domains for protein-protein interactions and protein complexes
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Conditional random field approach to prediction of protein-protein interactions using mutual information between domains
利用域之间的互信息预测蛋白质-蛋白质相互作用的条件随机场方法
利用域之间的互信息预测蛋白质-蛋白质相互作用的条件随机场方法
DOI：
--
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
--
作者：
[Hayashida, M., Kamada, M., Song, J. and Akutsu, T]
通讯作者：
T
DOI：
10.3233/ica-2012-0389
发表时间：
2010-06
期刊：
Integr. Comput. Aided Eng.
影响因子：
--
作者：
[M. Hayashida;Peiying Ruan;T. Akutsu]
通讯作者：
M. Hayashida;Peiying Ruan;T. Akutsu
DOI：
10.1186/1752-0509-4-s2-s13
发表时间：
2010-09-13
期刊：
BMC systems biology
影响因子：
--
作者：
[Hayashida M, Akutsu T]
通讯作者：
Akutsu T
DOI：
10.1109/isb.2011.6033167
发表时间：
2011-10
期刊：
2011 IEEE International Conference on Systems Biology (ISB)
影响因子：
--
作者：
[M. Kamada;M. Hayashida;Jiangning Song;T. Akutsu]
通讯作者：
M. Kamada;M. Hayashida;Jiangning Song;T. Akutsu
DOI：
10.1587/transinf.e94.d.2468
发表时间：
2011-12
期刊：
IEICE Trans. Inf. Syst.
影响因子：
--
作者：
[M. Hayashida;T. Akutsu]
通讯作者：
M. Hayashida;T. Akutsu
共 7 条
Development of protein function prediction methods with global substructures and interaction stochastic models
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批准号：16K00392
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项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额：$2.91万
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财政年份：2016
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负责人：HAYASHIDA Morihiro
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依托单位：