NMR-spektroskopische Charakterisierung der elementaren Proteinfaltung und der Nukleinsäurebindung des Kälteschockproteins CspB

冷休克蛋白 CspB 基本蛋白折叠和核酸结合的核磁共振波谱表征

• 批准号: 5391472
• 负责人: Professor Dr. Jochen Balbach
• 金额: --
• 依托单位: Fachgruppe Biophysik
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2001-12-31 至 2007-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5391472?language=en
• 关键词: NMR; spektroskopische; Charakterisierung; der; elementaren

Die molekularen Grundlagen der Proteinfaltungsreaktion sind immer noch in weiten Teilen unverstanden. Nach dem Studium langsamer Faltungsreaktionen und der Charakterisierung von Faltungsintermediaten mittels Echtzeit-NMR-Spektroskopie sollen jetzt die schnellen elementaren Faltungsschritte vornehmlich mit hochauflösender NMR-Spektroskopie untersucht werden. Als Modell wird das kleine DNA-bindende Kälteschockprotein CspB aus B. Subtilis dienen, dessen Übergangszustand während der Faltungsreaktion kartiert werden soll. Hierzu wollen wir die Ent- und Rückfaltungsraten basierend auf NMR-Resonanzen von möglichst allen Aminosäureresten bestimmen. Mögliche Vorzugskonformationen des denaturierten, aber faltungskompetenten Zustands sollen mit Hilfe von Relaxationsstudien und der Bestimmung von dipolaren Kopplungen erfolgen. Die Rolle der natürlichen Umgebung Wasser ist für die Faltung der Polypeptidkette von zentraler Bedeutung. Hier möchten wir mit NMR-Methoden die Wechselwirkungen einzelner Reste in verschiedenen Faltungszuständen mit den Wassermolekülen untersuchen. Parallel soll die Struktur eines CspB/RNA-Komplex in Lösung sowie der Einfluss einzelsträngiger Nukleinsäuren auf Struktur, Dynamik und Faltung von CspB untersucht werden. Wir erwarten aus diesen Studien detaillierte Einblicke in die elementaren Prozesse, die bei der Faltung und der Nukleinsäurebindung dieses einfachen Proteins ablaufen.

蛋白质反应的分子基础仍然是不稳定的。在研究长时间使用核磁共振波谱仪的超导反应和超导中间体的特性时，必须考虑使用高灵敏度的核磁共振波谱仪韦尔登的超导元件。用此模型从B中筛选出与Kälteschockprotein Csp B结合的小分子DNA。但事实上，这一切都是由韦尔登造成的。Hierzu wollen wir die Ent- und Rückfaltungsraten baserend auf NMR-Resonanzen von möglichst艾伦Aminosäuresten bestimmen. Mögliche Vorzugskonformationen des denaturierten，aber faltungskompetenten Zustands sollen mit Hilfe von Relaxationsstudien und der Bestimmung von dipolaren Kopplungen erfolgen. Die Rolle der natürlichen Umgebung瓦塞尔ist für die Faltung der Polyptidylamine von zentraler Bedeutung.在此，我们使用NMR方法将Wechselenkungen einzelner Reste in vertebraledenen Faltungszuständen与Wassermolekülen一起检测。在Lösung中并行求解一个CspB/RNA-Komplex的结构，从而对CspB的结构、动力学和故障产生影响。我们将详细介绍过程中的基本步骤，包括折叠和核蛋白结合的蛋白质。