Conformational dynamics measurement of EGFR by high-speed single-molecule FRET measurement

通过高速单分子 FRET 测量对 EGFR 构象动力学进行测量

• 批准号: 21710122
• 负责人: OKAMOTO Kenji
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21710122/
• 关键词: EGFR; 単一分子計測; FRET; 統計的データ解析; 高時間分解計測; 分子構造変化ダイナミクス

Single molecule FRET measurement on conformational dynamics of the EGFR molecule, which is related to signal transduction on the cell membrane, has been developed. Conditions for preparation and fluorescence labeling of EGFR were optimized and FRET signals were successfully observed while the dynamics measurements could have not been completed since it had been taken longer time to optimize EGFR expression conditions than initial expectation. A new method of experimental data analysis based on the variational Bayes was also developed, which improved the accuracy and the time resolution.

已经开发了与细胞膜上的信号转导相关的EGFR分子的构象动力学的单分子FRET测量。优化了EGFR的制备和荧光标记条件，成功观察到FRET信号，但由于优化EGFR表达条件所需的时间比初始预期的要长，因此动力学测量可能尚未完成。提出了一种基于变分贝叶斯的实验数据分析方法，提高了精度和时间分辨率。

项目成果

Single-molecule time-stamped FRET measurement of the spontaneous branch migration of the Holliday junction

霍利迪连接体自发分支迁移的单分子时间戳 FRET 测量

• 发表时间: 2010
• 作者: 岡本憲二;佐甲靖志
• 通讯作者: 佐甲靖志

単一分子ダイナミクスの実時間観察を可能にする2チャンネル同時タイムスタンプ計測

双通道同时时间戳测量可实时观察单分子动力学

• 发表时间: 2009
• 作者: 岡本憲二;佐甲靖志
• 通讯作者: 佐甲靖志

Holliday Junctionの自発的Branch Migrationのタイムスタンプ1分子FRET計測

霍利迪交界处自发分支迁移的时间戳单分子 FRET 测量

• 发表时间: 2010
• 作者: 岡本憲二;佐甲靖志
• 通讯作者: 佐甲靖志