Protein patterning and parallel analysis of DNA molecules by integrating nanoimprint lithography (NIL) and UV lithography (UVL)

通过集成纳米压印光刻 (NIL) 和紫外光刻 (UVL) 对 DNA 分子进行蛋白质图案化和并行分析

• 批准号: 21710129
• 负责人: YOKOKAWA Ryuji
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21710129/
• 关键词: ナノインプリント; MicroTAS; MEMS; 分子操作; DNA

We modified two ends ofλDNA by digoxigenin (DIG) and biotin for single molecule manipulation. One end labeled with DIG was immobilized on the glass surface coated by anti-DIG antibody, and the other end labeled with biotin was manipulated by gliding microtubules modified with streptavidin. After stretchingλDNA, a restriction enzyme was applied to visualize cleaving of the DNA molecule at single molecule level. To achieve highly parallel and massive DNA manipulation, we fabricated micro/nano scale perfusable multi-scale channel structures. Integration of nanoimprint lithography (NIL) and UV lithography (UVL) realized such a complex and multi-scale structures. It was evaluated by implementing a pressure-driven flow system and protein assay.

我们用地高辛（DIG）和生物素修饰λDNA的两端以进行单分子操作。用 DIG 标记的一端固定在涂有抗 DIG 抗体的玻璃表面上，用生物素标记的另一端通过链霉亲和素修饰的滑动微管进行操作。拉伸DNA后，应用限制性内切酶在单分子水平上观察DNA分子的切割。为了实现高度并行和大规模的DNA操作，我们制造了微/纳米级可灌注多尺度通道结构。纳米压印光刻（NIL）和紫外光刻（UVL）的集成实现了如此复杂的多尺度结构。通过实施压力驱动流系统和蛋白质测定对其进行评估。

项目成果

A nano-needle/microtubule composite gliding on a kinesin-coated surface for target molecule transport.

纳米针/微管复合材料在驱动蛋白涂层表面上滑动，用于目标分子运输。

• 发表时间: 2010
• 期刊: Lab on a Chip
• 影响因子: 6.1
• 作者: M. Tarhan;R. Yokokawa;C. Bottier;D. Collard;H. Fujita
• 通讯作者: H. Fujita

Versatile Microfluidic Total Internal Reflection (TIR)-based Devices : Application to Microbeads Velocity Measurement and Single Molecule Detection with Upright and Inverted Microscope

基于多功能微流控全内反射 (TIR) 的设备：使用正置和倒置显微镜进行微珠速度测量和单分子检测的应用

• 发表时间: 2009
• 期刊: Lab Chip vol.9
• 作者: N.C.H.Le;R.Yokokawa;D.V.Dao;T.D.Nguyen;J.Wells;S.Sugiyama
• 通讯作者: S.Sugiyama

Kinesin-Driven Oil Droplets Used as Carriers for Transportation of Solid Particles

驱动蛋白驱动的油滴用作固体颗粒运输的载体

• 发表时间: 2009
• 作者: C.Bottier;J.Fattaccioli;M.C.Tarhan;R.Yokokawa;B.J.Kim;D.Collard;H.Fujita
• 通讯作者: H.Fujita

せん断流を利用したタンパク質結合力の測定

使用剪切流测量蛋白质结合力

• 发表时间: 2010
• 作者: 横川隆司;酒井佑典;小此木孝仁;小寺秀俊
• 通讯作者: 小寺秀俊

Orientation Dependence of Shear Mode Piezoelectric Properties of Epitaxial Pb(Zrx, Til-x)O3 Thin Films

外延 Pb(Zrx, Til-x)O3 薄膜剪切模式压电性能的取向依赖性

• 发表时间: 2010
• 期刊: Jpn.J.Appl.Phys.
• 作者: Kenji Akama;Isaku Kanno;Ryuji Yokokawa;Kiyotaka Wasa;Hidetoshi Kotera
• 通讯作者: Hidetoshi Kotera