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Evolutionary mechanisms of the gastrula organizer and blastopore formation by focusing on the gene regulatory network

以基因调控网络为中心研究原肠胚组织者和胚孔形成的进化机制

基本信息

批准号：
22370075
负责人：
TAIRA Masanori
金额：
$ 11.98万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010-04-01 至 2013-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

In early vertebrate development, the basic body plan is established by the gastrula organizer. To examine the role of several transcription factors that play a central role in this important tissue as well as its evolutionary scenario, we carried out chromatin-immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq) analysis using Xenopus gastrula embryos. The data suggest that transcription factors Otx2, Lim1/Lhx1, Gsc, and Sia combinatorially bind to gene regulatory regions, and positively and negatively regulate several hundreds of genes. In addition, comparative functional analysis of regulatory regions between Xenopus and an ancient type of vertebrates, amphioxus, suggest a scenario, in which evolution in activities of regulatory regions of some organizer genes contributed for the vertebrate ancestor to have acquired the head structure.

在脊椎动物的早期发育中，基本的身体结构是由原肠胚组织者建立的。为了研究在这一重要组织中发挥核心作用的几种转录因子的作用及其进化情况，我们使用非洲爪蟾原肠胚进行了染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）分析。数据表明，转录因子Otx 2、Lim 1/Lhx 1、GSC和Sia组合结合于基因调节区，并对数百个基因进行正向和负向调节。此外，非洲爪蟾和一种古老的脊椎动物文昌鱼之间的调节区的比较功能分析表明，在这种情况下，一些组织者基因的调节区活动的进化有助于脊椎动物祖先获得头部结构。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Secreted Frizzled-related proteins (sFRPs) regulate extracellular distribution of Wnt ligands via interactions with heparan sulfate

分泌性卷曲相关蛋白 (sFRP) 通过与硫酸乙酰肝素相互作用调节 Wnt 配体的细胞外分布

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yusuke Mii;Kenichi Nakazato;Atsushi Mochizuki and Masanori Taira
通讯作者：
Atsushi Mochizuki and Masanori Taira

ChIP-seq法を用いた内胚葉と中胚葉形成におけるVegTとMix1の役割の解析

利用 ChIP-seq 方法分析 VegT 和 Mix1 在内胚层和中胚层形成中的作用

DOI：
发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
0
作者：
桐ケ谷嘉章;安岡有理;鈴木穣;高橋秀治;浅島誠;菅野純夫;平良眞規
通讯作者：
平良眞規

脊椎動物の頭部オーガナイザー獲得に関わるエンハンサー進化

增强子进化涉及脊椎动物头部组织的获得

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
Mito;T.;et al;安岡有理,丹藤由希子,窪川かおる,平良眞規
通讯作者：
安岡有理,丹藤由希子,窪川かおる,平良眞規

Molecular mechanisms of the regulation of rax expression by the inner nuclear membrane protein Nemp1 in vertebrate eye development

脊椎动物眼发育中核膜蛋白Nemp1调控rax表达的分子机制

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
高嶋明人;西井俊明;尾上順;柴野卓志
通讯作者：
柴野卓志

Otx2 and TLE/Groucho occupancy marks tissue-specific cis-regulatory modules for head specification

Otx2 和 TLE/Groucho 占用标记了头部规范的组织特异性顺式调节模块

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yasuoka Y.;Suzuki Y.;Takahashi S.;Haramoto Y.;Tando Y.;Kubokawa K.;Ken W.;Cho Asashima M.;Sugano S.;and Taira M.
通讯作者：
and Taira M.