Extensive investigation of the ring puckering paths of Glucose using quantum chemical calculation and the molecular design of cellulase

利用量子化学计算和纤维素酶分子设计对葡萄糖的环起皱路径进行广泛研究

• 批准号: 22500272
• 负责人: UEDA Kazuyoshi
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Yokohama National University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22500272/
• 关键词: コンピューターシミュレーション; コンピュータシミュレーション; 環変換; グルコース

The purpose of this work is to clarify the whole processes of the inter-conversion of the ring conformations of the glucopyranose ring using quantum mechanics calculation. The inter-conversion process can be represented by using Clemer-Pople parameter which is shown by the degrees of the latitude and the longitude on the surface of the globe. The results of this work indicated that there are many pathways which connect north pole 4C1 conformation and south pole 1C4 structure. It also found their transition structures of those paths. This information will help to consider the application of carbohydrate to the industrial use.

本工作的目的是澄清的葡萄糖吡喃糖环的环构象相互转换的整个过程，用量子力学计算。这种相互转换的过程可用Clemer-Pople参数来表示，Clemer-Pople参数用地球仪表面的经纬度表示。研究结果表明，北极4C 1构象与南极1C 4构象之间存在着多条连接途径。并找到了这些路径的过渡结构。这些信息将有助于考虑碳水化合物在工业上的应用。

项目成果

Structure and orientation of bovine lactoferrampin in the bacterial membrane as revealed by Solid-State NMR and molecular dynamics simulation.

通过固态核磁共振和分子动力学模拟揭示了细菌膜中牛乳铁蛋白的结构和方向。

• 发表时间: 2012
• 期刊: Biophys. J.
• 作者: Atsushi Tsutsumi;Namsrai Javkhlantugs;Atsushi Kira;Masako Umeyama;Izuru Kawamura;Kazuyoshi Ueda and Akira Naito
• 通讯作者: Kazuyoshi Ueda and Akira Naito

Ab initio Studies of the Crystal Structure of Cellulose Triacetate

三醋酸纤维素晶体结构的从头算研究

• 发表时间: 2012
• 作者: Takanori Kobayashi;Daich Hayakawa;Tegshjargal Khishigjargal;Kazuyoshi Ueda
• 通讯作者: Kazuyoshi Ueda

量子化学計算による1C4グルコース環配座変換経路の探索

利用量子化学计算寻找1C4葡萄糖环构象转化途径

• 发表时间: 2012
• 作者: 栗原庸次;上田一義;高橋絵理歌
• 通讯作者: 高橋絵理歌

セルローストリアセテートナノサイズ結晶の溶解過程に関する分子動力学シミュレーション

三醋酸纤维素纳米晶溶解过程的分子动力学模拟

• 发表时间: 2011
• 作者: 小林 正人;栗原 庸次;上田 一義;猪狩晋平,福村直博;早川大地・上田一義・山根千弘・宮本ひとみ・堀井文敬
• 通讯作者: 早川大地・上田一義・山根千弘・宮本ひとみ・堀井文敬

Gromacsのための計算支援ソフトGISPの開発

开发Gromacs的计算支持软件GISP

• 发表时间: 2012
• 期刊: J. Comput. Chem. Soc. Jpn
• 作者: 森一樹;樺島智大;源聡;玉城哲平;上田一義
• 通讯作者: 上田一義