Identification and validation of biomarker proteins based ontheir thiol redox states

基于硫醇氧化还原态的生物标志物蛋白的鉴定和验证

• 批准号: 22501035
• 负责人: KAWAKAMI Takao
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Tokyo Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22501035/
• 关键词: 酸化還元; プロテオーム; 化学修飾; 質量分析; 翻訳後修飾; 配列データベース; 蛋白質データベース; レドックス制御; バイオマーカー; 酸化修飾蛋白質; 癌

Cellular reduction-oxidation (redox) states are regulated mainly by the cysteine thiol groups in protein molecules. Using a fluorescent chemical probe specific with reductive thiol groups, we established reaction conditions for quantitative thiol modifications. Non-reduction/reduction two-dimensional electrophoresis is a promising choice towards comprehensive redox state analysis. Polyacrylamide gel strip backing with a plastic film enabled higher reproducibility of the first dimensional separation. In addition, we made a program of extracting peptide information containingselected post-translational modification(s) from public sequence databases.

细胞的还原氧化（氧化还原）状态主要由蛋白质分子中的半胱氨酸硫醇基团调节。使用具有还原性硫醇基团特异性的荧光化学探针，我们建立了定量硫醇修饰的反应条件。非还原/还原二维电泳是综合氧化还原态分析的一个有前景的选择。带塑料薄膜的聚丙烯酰胺凝胶条背衬能够实现第一维分离的更高再现性。此外，我们制作了一个从公共序列数据库中提取包含选定翻译后修饰的肽信息的程序。

项目成果

病態診断のためのプロテオームバイオマーカー: 探索、検証、および大規模スクリーニングへの適用

用于疾病诊断的蛋白质组生物标志物：探索、验证和大规模筛查的应用

• 发表时间: 2010
• 作者: MatsuuraM、Ushijima M;Yuba-KuboA,WakuiM;Hosaka K;Hayasaka T;Masaki N;Goto-Inoue N;Miyata S;Yao I;Setou M;Ogawa K;Kajihara S.;小黒明広;川上隆雄
• 通讯作者: 川上隆雄

病態診断のためのプロテオームバイオマーカー:探索、検証、および大規模スクリーニングへの適用(Proteomic biomarkers for clinical diagnosis : discovery, validation, and application to mass-screening)

用于临床诊断的蛋白质组生物标志物：发现、验证及其在大规模筛选中的应用

• 发表时间: 2010
• 作者: 川上隆雄;荻原淳
• 通讯作者: 荻原淳

Disulfide proteomics: Current status in thioredoxin biochemistry and industrial research

二硫键蛋白质组学：硫氧还蛋白生物化学和工业研究的现状

• 发表时间: 2012
• 期刊: JARQ-Japan Agricultural Research Quarterly
• 影响因子: 0.4
• 作者: 熊谷昌則;高橋徹;秋山美展;Kawakami T and Yano H.
• 通讯作者: Kawakami T and Yano H.

Sec14l3 is specifically expressed in mouse airway ciliated cells

Sec14l3 在小鼠气道纤毛细胞中特异性表达

• DOI: 10.1007/s10753-011-9363-z
• 发表时间: 2012
• 期刊: Inflammation
• 影响因子: 5.1
• 作者: L.Shan;S.Noritake;M.Fujiwara;S.Asano;C.Yoshida-Noro;N.Noro;K.Yamashita;T.Kawakami
• 通讯作者: T.Kawakami

肝臓癌形成のプロテオミクス:二次元液体クロマトグラフィー/タンデム質量分析による差分解析と新規診断マーカーの同定

肝癌形成的蛋白质组学：使用二维液相色谱/串联质谱进行差异分析和新诊断标记物的鉴定

• 发表时间: 2010
• 作者: 水上修作;松浦貴志;梶原千晶;宇田静葉;鵜殿平一郎;小黒明広;川上隆雄
• 通讯作者: 川上隆雄