Neutron structure analysis of human PGD synthase for elucidation of the reaction mechanism activated by metal ions

人 PGD 合成酶的中子结构分析，阐明金属离子激活的反应机制

• 批准号: 22550152
• 负责人: INOUE Tsuyoshi
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22550152/
• 关键词: 中性子線解析; 金属イオン; 酵素活性化機構; 中性子線構造解析; プロスタグランジンＤ合成酵素; 反応メカニズムの解明; 結晶の大型育成; プロスタグランジンD合成酵素; 反応メカニズムの明

Prostaglandin D_2(PGD_2) is an allergic and inflammatory mediator produced by hematopoietic PGDS (H-PGDS) in the presence of glutathione (GSH). Previously, we found that Ca^2+and Mg^2+activated the enzyme activity and uncovered the activation mechanism by the X-ray crystal structures of the Ca^2+- and Mg^2+-bound forms of human H-PGDS at high resolution. In this study, we performed the crystallization of H-PGDS to reveal the protonation state by neutron diffraction and obtained the crystals with maximum size of 0.5 mm^3with high quality.

前列腺素d2 （PGD_2）是造血PGDS （H-PGDS）在谷胱甘肽（GSH）存在下产生的一种过敏和炎症介质。在此之前，我们发现Ca^2+和Mg^2+激活了酶的活性，并通过高分辨率的Ca^2+和Mg^2+结合形式的人H-PGDS的x射线晶体结构揭示了酶的激活机制。在本研究中，我们通过中子衍射对H-PGDS进行了结晶，揭示了质子化状态，并获得了最大尺寸为0.5 mm^3的高质量晶体。

项目成果

Three-dimensional, non-invasive, cross-sectional imaging of protein crystals using ultrahigh resolution optical coherence tomography.

• DOI: 10.1364/boe.3.000735
• 发表时间: 2012-04-01
• 期刊: Biomedical optics express
• 影响因子: 3.4
• 作者: Nishizawa N;Ishida S;Hirose M;Sugiyama S;Inoue T;Mori Y;Itoh K;Matsumura H
• 通讯作者: Matsumura H

Spatially precise, soft microseeding of single protein crystalsby femtosecond laser ablation

通过飞秒激光烧蚀对单个蛋白质晶体进行空间精确、软微播种

• DOI: 10.1021/cg300018t
• 发表时间: 2012
• 期刊: Cryst. Growth Des.,
• 作者: S.Nakayama;H.Y.Yoshikawa;R.Murai;M.Kurata;M.Maruyama;S.Sugiyama;Y.Aoki;Y.Takahashi;M.Yoshimura;S.Nakabayashi;H.Adachi;H.Matsumura;T.Inoue;K.Takano;S.Murakami;and Y.Mori;Hiroshi Yoshikawa
• 通讯作者: Hiroshi Yoshikawa

Structure of the inhibitor complex of old yellow enzyme from Trypanosoma cruzi

克氏锥虫老黄酶抑制剂复合物的结构

• 发表时间: 2011
• 期刊: Journal of Synchrotron Radiation
• 影响因子: 2.5
• 作者: Keishi Yamaguchi;Naoki Okamoto;Keiji Tokuoka;Shigeru Sugiyama;Nahoko Uchiyama;Hiroyoshi Matsumura;Koji Inaka;Yoshihiro Urade;Tsuyoshi Inoue
• 通讯作者: Tsuyoshi Inoue

井上豪Home Page

井上刚主页

Structural basis enzymes in the pyrimidine biosynthetic pathway of human malaria parasite Plasmodium falciparum for in silico drug design

人类疟疾寄生虫恶性疟原虫嘧啶生物合成途径中的结构基础酶用于计算机药物设计

• 发表时间: 2011
• 作者: Y.Takashima;E.Mizohata;K.Tokuoka;Y.Kusakari;T.Uchida;S.R.Krungkrai;H.Matsumura;J.Krungkrai;T.Horii;T.Inoue
• 通讯作者: T.Inoue