Synthetic and Structural Biology Approach for Understanding Mechanism of AAA-ATPase

理解 AAA-ATPase 机制的合成和结构生物学方法

• 批准号: 22570118
• 负责人: HIROAKI Hidekazu
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Nagoya University (2011-2012)Kobe University (2010)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22570118/
• 关键词: 分子認識及び相互作用; マルチドメインタンパク質; 天然変性タンパク質; ATPase; AAA-ATPase; 膜輸送; 細胞骨格; 膜骨格; マルチドメイン蛋白質; AAAドメイン; MITドメイン; 微小管切断酵素; ESCRT-III複合体; ドミナントネガティブ変異体; タウタンパク質; ヒストンフォールド

We extensively used the 3D structural information of the N-terminal domains which were isolated from the other part of AAA-ATPases (Class I and II). We succeeded in determining the tubulin binding site on Katanin p^60 N-terminal domain. Subsequently we found a novel Ca^2+-dependent regulatory mechanism of Katanin’s ATPase activity. For NVL2, the solution structure as well as binding target of N-terminal domain were determined. We thus proposed two hypothesis, one is for the molecular mechanisms on microtubule severing, and another is for the cellular function of NVL2.We extensively used the 3D structural information of the N-terminal domains which were isolated from the other part of AAA-ATPases (Class I and II). We succeeded in determining the tubulin binding site on Katanin p60 N-terminal domain. Subsequently we found a novel Ca2+-dependent regulatory mechanism of Katanin’s ATPase activity. For NVL2, the solution structure as well as binding target of N-terminal domain were determined. We thus proposed two hypothesis, one is for the molecular mechanisms on microtubule severing, and another is for the cellular function of NVL2.

我们广泛地使用了从AAA-ATP酶（I类和II类）的其他部分分离的N-末端结构域的3D结构信息。我们成功地确定了Katanin p^60 N端结构域上的微管蛋白结合位点。随后，我们发现了Katanin ATP酶活性的一种新的Ca^2+依赖性调节机制。对于NVL 2，确定了溶液结构以及N-末端结构域的结合靶标。因此，我们提出了两个假设，一个是关于微管切割的分子机制，另一个是关于NVL 2的细胞功能。我们广泛使用了从AAA-ATP酶（I类和II类）的另一部分分离的N末端结构域的3D结构信息。我们成功确定了Katanin p60 N末端结构域上的微管蛋白结合位点。随后，我们发现了Katanin的ATP酶活性的一种新的Ca ~（2+）依赖的调节机制。对于NVL 2，确定了溶液结构以及N-末端结构域的结合靶标。因此，我们提出了两个假设，一个是微管切断的分子机制，另一个是NVL 2的细胞功能。

项目成果

IDEAL: the collection and visualization of knowledge regarding intrinsically disordered proteins verified by experiments

IDEAL：通过实验验证的有关本质无序蛋白质的知识的收集和可视化

• 发表时间: 2013
• 作者: 雨宮崇之;坂本盛宇;野辺由紀子;村上聖子;嘉戸裕美子;細田和男;小池亮太郎;廣明秀一;太田元規;福地佐斗志
• 通讯作者: 福地佐斗志

Structure and Mutagenesis Studies of the C-terminal Region of Licensing Factor Cdt1 Enable the Identification of Key Residues for Binding to Replicative Helicase Mcm Proteins

• DOI: 10.1074/jbc.m109.075333
• 发表时间: 2010-05-21
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Jee, JunGoo;Mizuno, Takeshi;Shirakawa, Masahiro
• 通讯作者: Shirakawa, Masahiro

天然変性タンパク質データベースIDEALの開発

自然变性蛋白质数据库IDEAL的开发

• 发表时间: 2012
• 作者: 雨宮崇之;坂本盛宇;野辺由紀子;村上聖子;細田和男;小池亮太郎;廣明秀一;太田元規;福地佐斗志 (福地)
• 通讯作者: 福地佐斗志 (福地)

研究室ホームページ(名古屋大学創薬科学研究科構造分子薬理学分野)

实验室主页（名古屋大学药学院研究生院结构分子药理学系）

Crystal structure of a PFU-PUL domain pair of Saccharomyces cerevisiae Doa1/Ufd3.

酿酒酵母 Doa1/Ufd3 的 PFU-PUL 结构域对的晶体结构。

• 发表时间: 2010
• 期刊: Kobe Journal of Medical Sciences
• 作者: Nishimasu;R.;Komori;H.;Higuchi;Y.;Nishimasu;H.;Hiroaki;H.
• 通讯作者: H.