Elucidation of bacteria and nematode community in rhizosphere interactions using stable isotope probing

使用稳定同位素探测阐明根际相互作用中的细菌和线虫群落

• 批准号: 22580069
• 负责人: SAKAI Masao
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Kagoshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22580069/
• 关键词: 土壌センチュウ; 土壌微生物; DGGE; rDNA; 18S rDNA

Denaturing gradient gel electrophoresis of PCR amplicons of thenematode 18S rDNA-ITS region was developed and employed to investigate the effect of three different pesticides on soil nematode communities. In addition, it was found that the combination of identification of bacteria by MALDI-TOF MS and a protein-based stable isotope probing might be useful for analysis of community structure.

建立了线虫18S rDNA-ITS区DNA片段的变性梯度凝胶电泳法，研究了3种不同农药对土壤线虫群落的影响。此外，研究还发现，MALDI-TOF MS鉴定细菌与基于蛋白质的稳定同位素探测相结合可能有助于群落结构的分析。

项目成果

MALDI-TOF MS によるダイズ根粒菌の迅速同定に関する研究

MALDI-TOF MS快速鉴定大豆根瘤菌的研究

• 发表时间: 2012
• 作者: 坂上さゆみ;池永 誠;佐伯雄一;境 雅夫
• 通讯作者: 境 雅夫

MALDI-TOF MSによるダイズ根粒菌の迅速同定に関する研究

MALDI-TOF MS快速鉴定大豆根瘤菌的研究

• 作者: 坂上さゆみ;池永 誠;佐伯雄一;境 雅夫;野村美加;坂上さゆみ 池永 誠 佐伯雄一 境 雅夫
• 通讯作者: 坂上さゆみ 池永 誠 佐伯雄一 境 雅夫