Elucidation of the protonation mechanisms of ferredoxin-dependent bilin reductase by neutron crystallography

通过中子晶体学阐明铁氧还蛋白依赖性胆碱还原酶的质子化机制

• 批准号: 22770096
• 负责人: UNNO Masaki
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Ibaraki University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22770096/
• 关键词: 酵素; フィコシアノビリン; PcyA; 中性子結晶解析; 水素原子; 反応機構; 大型結晶; 宇宙実験; 高分解能; 中性子結晶構造解析; ビリン還元酵素; シアノバクテリア; 結晶成長

We succeeded obtaining a big crystal of PcyA, a ferredoxin-dependent bilin reductase, which biosynthesizes an important pigment pytochromobilin. The crystal diffracted neutron up to 2.6 A resolution. If we can obtain bigger crystal than this one, we will able to structural analysis beyond 2 A resolution, and determine the position of hydrogen atoms in the structure. The reaction mechanism will be elucidated, soon.

我们成功地获得了一个大晶体的PcyA，铁氧还蛋白依赖性的胆色素还原酶，生物合成一个重要的色素pytochromobilin。该晶体衍射中子的分辨率高达2.6 A。如果我们能获得比这个更大的晶体，我们将能够进行超过2A分辨率的结构分析，并确定氢原子在结构中的位置。反应机理很快就会被阐明。

项目成果

Solution 1H NMR characterization of substrate-free C. diphtheriae heme oxygenase: Pertinence for determining magnetic axes in paramagnetic substrate complexes

• DOI: 10.1016/j.jinorgbio.2010.06.003
• 发表时间: 2010-10-01
• 期刊: JOURNAL OF INORGANIC BIOCHEMISTRY
• 影响因子: 3.9
• 作者: Du, Zhenming;Unno, Masaki;La Mar, Gerd N.
• 通讯作者: La Mar, Gerd N.

中性子結晶構造解析を目指したフェレドキシン依存性ビリン還元酵素PcyAの結晶成長

用于中子晶体结构分析的铁氧还蛋白依赖性胆碱还原酶 PcyA 的晶体生长

• 发表时间: 2010
• 作者: 石川久美子;萩原義徳;和田啓;小原裕二;黒木良太;玉田太郎;福山恵一;海野昌喜
• 通讯作者: 海野昌喜

Structure-based Drug Design for Kainate-type Ionotropic Glutamate Receptors, GluK1 and GluK2, from Human Brain

基于结构的人脑红藻氨酸型离子型谷氨酸受体 GluK1 和 GluK2 药物设计

• 发表时间: 2010
• 期刊: Photon Factory Activity Report 2009, PART B
• 作者: Unno;M.;et al.
• 通讯作者: et al.

Understanding of Nitric Oxide-Binding Mechanism of Cytochrome c' Based on Atomic Resolution Structure

基于原子分辨率结构理解细胞色素c的一氧化氮结合机制

• 发表时间: 2010
• 作者: Kumiko Ishikawa;et al.;Masaki Unno
• 通讯作者: Masaki Unno

ブルー銅タンパク質シュウドアズリンにおける銅イオンのダイナミクス

蓝铜蛋白伪天青中的铜离子动力学

• 发表时间: 2011
• 作者: 浅村紗矢香;他
• 通讯作者: 他