High pressure NMR study for conformational fluctuation of polyubiquitin

多聚泛素构象波动的高压核磁共振研究

• 批准号: 22770114
• 负责人: KITAHARA Ryo
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Ritsumeikan University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22770114/
• 关键词: 蛋白質; 圧力; NMR; 高圧力; ジユビキチン; 構造揺らぎ; ポリユビキチン; 高エネルギー構造; 水和

We investigated conformational fluctuation of Lys48-linked linear diubiquitin, as a minimum model of polyubiquitin chains, by using high-pressure NMR spectroscopy. Comparing pressure induced changes in chemical shifts between mono-ubiquitin and diubiquitin, we found that pressure stabilizes the "open" orientation of the two subunits for diubiquitin and the subunits have similar intrinsic motion to those of mono-ubiquitin. It is suggested that the intrinsic fluctuation of the subunits plays an essential role in the adaptation of global conformation of diubiquitin to the environment.

我们通过使用高压核磁共振波谱研究了 Lys48 连接的线性双泛素的构象波动，作为多泛素链的最小模型。比较压力引起的单泛素和双泛素之间化学位移的变化，我们发现压力稳定了双泛素两个亚基的“开放”方向，并且这些亚基具有与单泛素相似的内在运动。这表明亚基的内在波动在双泛素整体构象适应环境中起着重要作用。

项目成果

タンパク質の高エネルギー構造に注目した新しい構造生物学の展開

专注于蛋白质高能结构的新结构生物学发展

• 发表时间: 2011
• 作者: Liu;W.;Sato;A.;et al.;北原亮
• 通讯作者: 北原亮

準安定状態が安定化されたユビキチン変異体

具有稳定亚稳态的泛素突变体

• 发表时间: 2010
• 作者: 北沢創一郎;矢木真穂;菅瀬謙治;加藤晃一;北原亮
• 通讯作者: 北原亮

高圧力NMR法によるユビキチンの高エネルギー構造に基づく構造-機能相関研究

基于泛素高能结构的高压核磁共振法结构-功能关系研究

• 发表时间: 2010
• 作者: 北原亮;北沢創一郎;坂田絵理;平野貴志;矢木内海真穂;谷口吉弘;水島恒裕;赤坂一之;加藤晃一
• 通讯作者: 加藤晃一

High pressure NMR reveals a delicate interplay of protein's structure, dynamics, and thermodynamics for function

高压核磁共振揭示了蛋白质结构、动力学和功能热力学之间的微妙相互作用

• 发表时间: 2012
• 作者: Kitahara R.;Kitazawa S.;Yagi-Utsumi M.;Ido A.;Urushitani M.;Sugase K.;Kato K.;吉 種光;Ngoc-Hien Du;今村聖路;北原亮;布川莉奈;北原亮
• 通讯作者: 北原亮

Conformational fluctuation of Lys48-linked diubiquitin studied by high pressure NMR spectroscopy

高压核磁共振波谱研究 Lys48 连接的双泛素的构象波动

• 发表时间: 2011
• 作者: Ryo Kitahara;Takashi Hirano;Maho Yagi;Kazumi Hata;Kazuyuki Akasaka;Koichi Kato
• 通讯作者: Koichi Kato