Discovery of biomarkers for early colon cancer using a phospho-proteomic approach

使用磷酸蛋白质组学方法发现早期结肠癌的生物标志物

• 批准号: 22790539
• 负责人: KUGA Takahisa
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: 独立行政法人医薬基盤研究所
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22790539/
• 关键词: 腫瘍検査学; 大腸癌; タンパク質リン酸化; バイオマーカー; プロテオーム解析; Phospho-iTRAQ法; SRM法; 血中バイオマーカー

The profile of protein phosphorylation in colon malignant tumor tissues were compared with those in colon benign tumor and non-tumor tissues using a phospho-proteomic technique(Phospho-iTRAQ). Phosphorylation levels at more than 200 phosphorylation sites were altered in the malignant tumor tissues, suggesting that these alterations are candidates for colon cancer. To validate these candidates, a phospho-SI-SRM technique was developed. Using these proteomic techniques and bioinformatics, I identified candidate biomarkers for colon cancer and signaling proteins involved in colon cancer.

用磷酸化蛋白质组学技术比较了结肠恶性肿瘤组织、良性肿瘤组织和非肿瘤组织中蛋白质磷酸化的差异。在恶性肿瘤组织中，200多个磷酸化位点的磷酸化水平发生了变化，表明这些变化是结肠癌的候选基因。为了验证这些候选基因，开发了一种磷酸化的SI-SRM技术。使用这些蛋白质组学技术和生物信息学，我确定了结肠癌的候选生物标记物和与结肠癌有关的信号蛋白。

项目成果

Phosphorylation statuses at different residues of lamin B2, B1, and A/C dynamically and independently change throughout the cell cycle

• DOI: 10.1016/j.yexcr.2010.05.017
• 发表时间: 2010-08-15
• 期刊: EXPERIMENTAL CELL RESEARCH
• 影响因子: 3.7
• 作者: Kuga, Takahisa;Nozaki, Naohito;Tomonaga, Takeshi
• 通讯作者: Tomonaga, Takeshi

大腸癌臨床検体を用いた定量的大規模リン酸化プロテオーム解析

使用临床结直肠癌样本进行大规模定量磷酸化蛋白质组分析

• 发表时间: 2010
• 作者: Kimura T;Yoshimura K;Aoki H;Ikeda Y;Hamano K;Imanaka-Yoshida K;Yoshida T;Hiroe M;Aonuma K and Matsuzaki M;久家貴寿
• 通讯作者: 久家貴寿

定量的リン酸化プロテオミクスとバイオインフォマティクスを用いた大腸がんリン酸化シグナル伝達機構の包括的理解

利用定量磷酸蛋白质组学和生物信息学全面了解结直肠癌磷酸化信号机制

• 发表时间: 2011
• 作者: Kasuya J;et al;久家貴寿
• 通讯作者: 久家貴寿

ヒト大腸癌臨床検体を用いたリン酸化プロテオーム解析による新規転移因子の探索

利用人类结直肠癌临床标本进行磷酸化蛋白质组分析寻找新的转移元件

• 发表时间: 2011
• 作者: 玉井宏明;森崎浩一;宮地紘樹;前川卓史;高橋範子;渡辺芳雄;森前博文;井原努;堀昭彦;坂野比呂志;小林昌義;山本清人;古森公浩;岡沢秀彦;白水崇
• 通讯作者: 白水崇

リン酸化プロテオミクスを用いた新規DNA損傷初期応答キナーゼの探索

使用磷酸蛋白质组学寻找新型 DNA 损伤早期反应激酶

• 发表时间: 2011
• 作者: 足立淳;鳴海良平;佐野聖三;久家貴寿;白水崇;松本雅記;中山敬一;井倉正枝;井倉毅;高田穣;朝長毅
• 通讯作者: 朝長毅