全ゲノム連関マッピングによるイネもみ枯細菌病抵抗性遺伝子の単離

通过全基因组关联作图分离水稻白叶枯病抗性基因

基本信息

批准号：
11F01518
负责人：
齋藤宏昌
金额：
$ 0.58万
依托单位：
Iwate Biotechnology Research Center
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011 至 2012
项目状态：
已结题

项目摘要

このプロジェクトの目的は大規模組み換え近交系(RIL系統群)を供試して、イネもみ枯細菌病抵抗性に関与する遺伝子を同定することである。RIL系統群の作製には、種子親として遺伝的多様性を示すイネコアセレクション17品種、花粉親としてイネ品種「ひとめぼれ」をそれぞれ用いた。まず、各親品種の茎にイネもみ枯細菌病菌を接種し、病徴を観察した結果、イネもみ枯細菌病感染に対して抵抗性または感受性を示す品種が選抜された。「ひとめぼれ」(抵抗性)と対象的な表現型を示す「カサラス」、「Shoni」、「蒙古稲」、「Keiboba」、および「Urasan 1」(いずれも感受性)のRIL系統群について、イネもみ枯細菌病菌の接種試験を行い、表現型の分離を観察した。さらに、ゲノム上の1,536個上のSNPマーカーを用いて連鎖解析を行い、イネもみ枯細菌病抵抗性と連関するQTL(量的形質遺伝子座)の同定を試みた結果、複数の染色体の様々な特定領域が見出された。その中で、「ひとめぼれ」と「Shoni」との間で見出された領域は、イネもみ枯細菌病抵抗性に関与するQTLとして2010年に報告された第3番染色体に座上する領域と同じ領域であった(Pinson et al., 2010 Crop Sci. 50:1287)。当研究グループでは、次世代シーケンサーを用いることで、DNAマーカーを作成することなく迅速にQTLを同定する技術rQTL-seq法」を確立している(Takagi et al., 2013 Plant J. 74:174)。そこで、「ひとめぼれ」と「Shoni」のRIL系統群にQTL-seq法を適用したところ、イネもみ枯細菌病抵抗性と連関する主要なQTLは、従来のQTL解析の結果と同様に第3番染色体の特定領域に見出された。

该项目的目的是测试大规模重组近交系（RIL谱系组），以鉴定涉及抗稻病细菌疾病的基因。为了准备RIL谱系组，有17种大米核心选择品种作为种子父母表现出遗传多样性，而水稻品种则用作花粉父母。首先，每个父母的茎被水稻疾病细菌接种，并且由于观察到症状，选择了对水稻疾病感染的抗性或易感的品种。对“ hitomebore”（耐药性）和靶型表型的RIL组中的水稻细菌疾病细菌进行接种测试，并观察到表型。此外，使用基因组上的1,536个SNP标记进行了连锁分析，并试图鉴定与与水稻细菌疾病抗性有关的QTL（定量性状基因座），并发现了多个染色体的各种特定区域。其中，发现“ hitomebore”和“ shoni”之间的区域与位于3号染色体上的区域是同一区域，该区域在2010年据报道，据报道，QTL涉及对水稻疫病细菌疾病的抗性（Pinson等，2010 CropSci。50：1287）。我们的研究小组已经建立了RQTL-Seq技术，该技术使用下一代序列仪快速识别QTL而不创建DNA标记（Takagi等，2013 Plant J. 74：174）。因此，当将QTL-SEQ应用于hitomebore和Shoni的RIL系统发育基团时，在3染色体3的特定区域中发现了与与水稻疾病的抗性相关的主要QTL，类似于常规QTL分析的结果。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Deployment of Burkholderia glumae type III secretion system as an efficient tool for translocating pathogen effectors to monocot cells.

将伯克霍尔德氏菌 III 型分泌系统部署为将病原体效应子转移到单子叶植物细胞的有效工具。

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
Shailendra Sharma、Shiveta Sharma、吉田健太郎、藤崎恒喜、伊東明子;ら
通讯作者：
ら

Deployment of the Burkholderia glumae type III secretion system as an efficient tool for translocating pathogen effectors to monocot cells.

DOI：
10.1111/tpj.12148
发表时间：
2013-05
期刊：
The Plant journal : for cell and molecular biology
影响因子：
0
作者：
Shailendra Sharma;Shiveta Sharma;Akiko Hirabuchi;Kentaroh Yoshida;K. Fujisaki;A. Ito;Aiko Uemura;R. Terauchi;S. Kamoun;K. Sohn;Jonathan D. G. Jones;H. Saitoh
通讯作者：
Shailendra Sharma;Shiveta Sharma;Akiko Hirabuchi;Kentaroh Yoshida;K. Fujisaki;A. Ito;Aiko Uemura;R. Terauchi;S. Kamoun;K. Sohn;Jonathan D. G. Jones;H. Saitoh

イネもみ枯細菌病菌III型分泌機構を利用したイネいもち病菌エフェクタ-の単子葉植物細胞内への移行

利用稻瘟菌III型分泌机制将稻瘟菌效应子转移至单子叶植物细胞中