全ゲノム連関マッピングによるイネもみ枯細菌病抵抗性遺伝子の単離

通过全基因组关联作图分离水稻白叶枯病抗性基因

• 批准号: 11F01518
• 负责人: 齋藤 宏昌
• 金额: $ 0.58万
• 依托单位: Iwate Biotechnology Research Center
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11F01518/
• 关键词: RIL系統群; 遺伝的多様性; イネコアセレクション; ひとめぼれ; SNPマーカー; 連鎖解析; 次世代シーケンサー; QTL-seq法; QTL; 表現型分離試験

このプロジェクトの目的は大規模組み換え近交系(RIL系統群)を供試して、イネもみ枯細菌病抵抗性に関与する遺伝子を同定することである。RIL系統群の作製には、種子親として遺伝的多様性を示すイネコアセレクション17品種、花粉親としてイネ品種「ひとめぼれ」をそれぞれ用いた。まず、各親品種の茎にイネもみ枯細菌病菌を接種し、病徴を観察した結果、イネもみ枯細菌病感染に対して抵抗性または感受性を示す品種が選抜された。「ひとめぼれ」(抵抗性)と対象的な表現型を示す「カサラス」、「Shoni」、「蒙古稲」、「Keiboba」、および「Urasan 1」(いずれも感受性)のRIL系統群について、イネもみ枯細菌病菌の接種試験を行い、表現型の分離を観察した。さらに、ゲノム上の1,536個上のSNPマーカーを用いて連鎖解析を行い、イネもみ枯細菌病抵抗性と連関するQTL(量的形質遺伝子座)の同定を試みた結果、複数の染色体の様々な特定領域が見出された。その中で、「ひとめぼれ」と「Shoni」との間で見出された領域は、イネもみ枯細菌病抵抗性に関与するQTLとして2010年に報告された第3番染色体に座上する領域と同じ領域であった(Pinson et al., 2010 Crop Sci. 50:1287)。当研究グループでは、次世代シーケンサーを用いることで、DNAマーカーを作成することなく迅速にQTLを同定する技術rQTL-seq法」を確立している(Takagi et al., 2013 Plant J. 74:174)。そこで、「ひとめぼれ」と「Shoni」のRIL系統群にQTL-seq法を適用したところ、イネもみ枯細菌病抵抗性と連関する主要なQTLは、従来のQTL解析の結果と同様に第3番染色体の特定領域に見出された。

The purpose of this study was to test and identify genes associated with bacterial disease resistance by large-scale mass replacement of inbred lines (RIL lineage). The diversity of RIL system groups, seed parents and pollen parents is shown in the following ways: The results of inoculation, disease characteristics, resistance and susceptibility of each parent variety to bacterial infection were observed. The phenotypes of the ""(resistance) and ""(resistance) targets were expressed as " In addition, 1,536 SNPs on the genome were used for genetic linkage, and QTL(quantitative qualitative loci) associated with bacterial disease resistance were identified. QTL related to bacterial disease resistance was reported in 2010 on chromosome 3. 2010 Crop Sci. 50:1287)。When the study was carried out, the next generation of QTL was identified by the QTL-seq method (Takagi et al., 2013 Plant J. 74:174)。QTL-seq method was applied to RIL system group of "Shoni","Shoni","," Shoni ",","Shoni","Shoni","," Shoni ",

项目成果

Deployment of the Burkholderia glumae type III secretion system as an efficient tool for translocating pathogen effectors to monocot cells.

• DOI: 10.1111/tpj.12148
• 发表时间: 2013-05
• 期刊: The Plant journal : for cell and molecular biology
• 作者: Shailendra Sharma;Shiveta Sharma;Akiko Hirabuchi;Kentaroh Yoshida;K. Fujisaki;A. Ito;Aiko Uemura;R. Terauchi;S. Kamoun;K. Sohn;Jonathan D. G. Jones;H. Saitoh

Deployment of Burkholderia glumae type III secretion system as an efficient tool for translocating pathogen effectors to monocot cells.

将伯克霍尔德氏菌 III 型分泌系统部署为将病原体效应子转移到单子叶植物细胞的有效工具。

• 发表时间: 2012
• 作者: Shailendra Sharma、Shiveta Sharma、吉田健太郎、藤崎恒喜、伊東明子;ら
• 通讯作者: ら

Isolation of Burkholderia glumae resistance genes from rice using whole genome association mapping

利用全基因组关联图谱从水稻中分离颖壳伯克霍尔德氏菌抗性基因

• 发表时间: 2012
• 作者: Shiveta Sharma、Shailendra Sharma、斎藤宏昌、高木宏樹、阿部陽;ら
• 通讯作者: ら

イネもみ枯細菌病菌III型分泌機構を利用したイネいもち病菌エフェクタ-の単子葉植物細胞内への移行

利用稻瘟菌III型分泌机制将稻瘟菌效应子转移至单子叶植物细胞中

• 发表时间: 2013
• 作者: 齋藤宏昌;Shailendra Sharma ら
• 通讯作者: Shailendra Sharma ら