Hierarchical Study on Protein Functional Mechanism

蛋白质功能机制的层次研究

• 批准号: 22651079
• 负责人: KAMIJO Shunsuke
• 金额: $ 2.27万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22651079/
• 关键词: アミロイド線維; アルギニン; アルツハイマー病; 低分子化合物; ファージディスプレイ; ペプチドライブラリー; クマリン; globulomer; SciFinder; 蛋白質; インフォマティクス; アミロイドβ; 抗体; ペプチド; プロドラッグ

In general protein engineering studies for functional mechanism of biomolecules, experiments using wet materials and informatics using dry computers are independently performed. However, it will be necessary for breakthrough of understanding of protein functional mechanisms to combine the experiments with the informatics methods synergistically. In this study, by using a phage display method as an experiment and an optimization method as informatics, novel short peptides and a small compound were found to inhibit fibrillation and soluble oligomer formation of amyloidβprotein.

在针对生物分子功能机制的一般蛋白质工程研究中，使用湿材料的实验和使用干计算机的信息学是独立进行的。然而，为了突破对蛋白质功能机制的理解，需要将实验与信息学方法协同结合。本研究以噬菌体展示法为实验，以信息学为优化方法，发现新型短肽和小化合物可以抑制β淀粉样蛋白的纤维化和可溶性低聚物形成。

项目成果

Inhibition of Aggregation of Amyloid β42 by Arginine-Containing Small Compounds

• DOI: 10.1271/bbb.110879
• 发表时间: 2012-04-01
• 期刊: BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY
• 影响因子: 1.6
• 作者: Kawasaki, Takayasu;Kamijo, Shunsuke
• 通讯作者: Kamijo, Shunsuke

Universal Optimizations of Scoring Functions for Virtual Screening

虚拟筛选评分函数的通用优化

• 发表时间: 2010
• 期刊: CBI Journal
• 作者: Onodera K;Kamijo S
• 通讯作者: Kamijo S

Selection of Peptide Inhibitors of Soluble Aβ_<1-42> Oligomers Formation by Phage Display

通过噬菌体展示筛选可溶性 Aβ_<1-42> 寡聚物形成的肽抑制剂

• 发表时间: 2010
• 期刊: Biosci. Biotechnol. Biochem.
• 作者: Takayasu Kawasaki;Kenji Onodera;Shunsuke Kamijo
• 通讯作者: Shunsuke Kamijo