adductome analysis of human tissues

人体组织加合组分析

• 批准号: 22659072
• 负责人: SUGIMURA Haruhiko
• 金额: $ 1.94万
• 依托单位: Hamamatsu University School of Medicine
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22659072/
• 关键词: DNA付加体; adductome; 炎症; 脂質過酸化物; 胃がん; 塩基除去修復LC-MS; ゲノム; 塩基除去修復; LC-MS; DNA修復; 遺伝子多型; がんの分子疫学; 変異原; 環境発がん

High performance liquid chromatography and tandem mass spectrometry disclosed at least 10 lipid peroxidation related modified DNA bases in the DNAs extracted under anti-oxidation condition from human autopsy tissues. Among these 10 DNA adducts, 7 of them, 1, N6-etheno-2'-deoxyadenosine(εdA), butanone-etheno-2'-deoxycytidine(BεdC), butanone-etheno-2'-deoxy-5-methylcytidine(BεmedC), butanoneetheno-2'-deoxyadenosine(BεdA), heptanone-etheno-2'-deoxycytidine(HεdC), heptanone-etheno-2'-deoxyadenosine(HεdA), and heptanone-etheno-2'-deoxyguanosine(HεdG) were quantitated in gastric mucosa, resected for gastric cancer in Japan and China. The profiles of these DNA adducts identified the origin of the tissues(China or Japan), implying adductome profile may reflect environmental exposures of individual settings. We further tested the repair machinery against these modified bases and discovered TDG play s role in repairing some of these adducts.

高效液相色谱-串联质谱法检测了抗氧化条件下提取的人尸检组织DNA中至少10个与脂质过氧化有关的修饰碱基。在这10种DNA加合物中，其中7种在胃粘膜中定量，即1，N6-乙烯基-2 '-脱氧腺苷（εdA）、丁酮-乙烯基-2'-脱氧胞苷（BεdC）、丁酮-乙烯基-2 '-脱氧-5-甲基胞苷（BεmedC）、丁酮-乙烯基-2'-脱氧腺苷（BεdA）、庚酮-乙烯基-2 '-脱氧胞苷（HεdC）、庚酮-乙烯基-2'-脱氧腺苷（HεdA）和庚酮-乙烯基-2 '-脱氧鸟苷（HεdG）。在日本和中国因胃癌被切除。这些DNA加合物的图谱确定了组织的来源（中国或日本），这意味着内收体图谱可能反映了个体环境的环境暴露。我们进一步测试了针对这些修饰碱基的修复机制，发现TDG在修复这些加合物中的一些中发挥作用。

项目成果

Detection of Lipid Peroxidation-Induced DNA Adducts Caused by 4-Oxo-2(E)-nonenal and 4-Oxo-2(E)-hexenal in Human Autopsy Tissues

• DOI: 10.1021/tx100047d
• 发表时间: 2010-09-01
• 期刊: CHEMICAL RESEARCH IN TOXICOLOGY
• 影响因子: 4.1
• 作者: Chou, Pei-Hsin;Kageyama, Shinji;Matsuda, Tomonari
• 通讯作者: Matsuda, Tomonari

Novel Single Nucleotide Polymorphism of the CYP2A13 Gene in Japanese Individuals

日本人CYP2A13基因的新单核苷酸多态性

• DOI: 10.2133/dmpk.dmpk-11-sc-033
• 发表时间: 2011
• 期刊: Drug Metabolism and Pharmacokinetics
• 影响因子: 2.1
• 作者: Tamaki;Y.;Honda;M.;Muroi;Y.;Arai;T.;Sugimura;H.;Matsubara;Y.;Kanno;S.;Ishikawa;M.;Hirasawa;N;Hiratsuka;M.
• 通讯作者: M.

酸化的DNA損傷修復に関わる遺伝子多型とヒト発がん

基因多态性参与氧化DNA损伤修复和人类致癌作用

• 发表时间: 2011
• 作者: 要匡;その他;椙村春彦
• 通讯作者: 椙村春彦

ヒトのcommonながんの遺伝的感受性について

对常见人类癌症的遗传易感性

• 发表时间: 2011
• 作者: 及川将弘;その他;金井好克;椙村春彦
• 通讯作者: 椙村春彦

Adenine DNA glycosylase activity of 14 human MutY homolog (MUTYH) variant proteins found in patients with colorectal polyposis and cancer.

在结直肠息肉病和癌症患者中发现的 14 种人类 MutY 同源物 (MUTYH) 变异蛋白的腺嘌呤 DNA 糖基化酶活性。

• DOI: 10.1002/humu.21363
• 发表时间: 2010-11
• 期刊: HUMAN MUTATION
• 影响因子: 3.9
• 作者: Goto, Masanori;Shinmura, Kazuya;Nakabeppu, Yusaku;Tao, Hong;Yamada, Hidetaka;Tsuneyoshi, Toshihiro;Sugimura, Haruhiko
• 通讯作者: Sugimura, Haruhiko