Ecology of diatom DNA and RNA viruses in marine environments

海洋环境中硅藻DNA和RNA病毒的生态学

• 批准号: 22688016
• 负责人: TOMARU Yuji
• 金额: $ 16.72万
• 依托单位: Fisheries Research Agency
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22688016/
• 关键词: 珪藻; ウイルス; 生態; Chaetoceros; DNA; RNA; DNAウイルス; RNAウイルス; 現場動態; 抗体; ウイルス種判別; 微細藻類

Since the first discovery of a diatom-infecting virus, viral infection is assumed to be a significant factor affecting the dynamics of diatoms. Recently, two diatom viruses, CtenDNAV and CtenRNAV, which share the same host species, Chaetoceros tenuissimus, were isolated and characterised. We evaluated the relationships between water temperature and viral infections. The results showed that the host population decline due to CtenDNAV was faster at higher water temperatures, and vice versa for CtenRNAV. The susceptibilities of the host species to CtenRNAV were diverse among the strains, and they changed along with water temperature, but not for CtenDNAV. These virus proliferation characteristics, including dependency on water temperature, might be important factors affecting the diatom hos and virus relationship, resulting in both their dominance and survival in nature.

自首次发现感染硅藻的病毒以来，病毒感染被认为是影响硅藻动态的重要因素。最近，两种硅藻病毒，CtenDNAV和CtenRNAV，共享相同的宿主物种，Chaetoceros tenuissimus，分离和表征。我们评估了水温和病毒感染之间的关系。结果表明，水温越高，CtenDNAV引起的寄主种群下降越快，CtenRNAV引起的寄主种群下降越慢。不同寄主对CtenRNAV的亲和性不同，且沿着水温变化而变化，但对CtenDNAV的亲和性不随水温变化而变化。这些病毒增殖特性，包括对水温的依赖性，可能是影响硅藻宿主和病毒关系的重要因素，导致它们在自然界中的优势和生存。

项目成果

Isolation and characterization of a single-stranded DNA virus infecting the marine planktonic diatom Chaetoceros sp

感染海洋浮游硅藻角毛藻的单链 DNA 病毒的分离和表征

• 发表时间: 2012
• 期刊: Plankton Benthos Res
• 影响因子: 0.6
• 作者: Toyoda;K.;Kimura;K.;Hata;N.;Nakayama;N.;Nagasaki;K.;Tomaru;Y
• 通讯作者: Y

Diatom viruses isolated from Japanese coastal waters

从日本沿海水域分离出的硅藻病毒

• 发表时间: 2012
• 作者: Tomaru Y;Kimura K;藤原洋一;大関芳沖・髙須賀明典・坪井守夫・木立孝・鈴木秀彌・服部茂昌;Yuji Tomaru
• 通讯作者: Yuji Tomaru

海産珪藻Chaetoceros setoensisに感染する新奇一本鎖DNAウイルスの性状

感染海洋硅藻角毛藻的新型单链 DNA 病毒的特征

• 发表时间: 2011
• 作者: 外丸裕司;豊田健介;南雲保;鈴木秀和;長崎慶三
• 通讯作者: 長崎慶三

Application of real-time PCR assay for detection and quantification of Chaetoceros tenuissimus Meunier (Bacillariophyta)

应用实时荧光定量 PCR 检测和定量角毛藻 (Chaetoceros tenuissimus Meunier)（硅藻门）

• 发表时间: 2010
• 期刊: Plankton Benthos Res
• 影响因子: 0.6
• 作者: Toyoda K;Nagasaki K;Tomaru Y
• 通讯作者: Tomaru Y

珪藻DNA/RNAウイルスの増殖と水温の関係

硅藻DNA/RNA病毒增殖与水温的关系

• 发表时间: 2013
• 作者: 外丸裕司;木村圭
• 通讯作者: 木村圭