RNA interactome prediction in eukaryotic genomes
RNA interactome prediction in eukaryotic genomes
批准号:
22700304
负责人:
TANEDA Akito
金额:
$1.41万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2010
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2010 至 2011
中文摘要
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英文摘要
We have developed computational RNA sequence analysis tools including a prediction system for RNA sequence alignment and an RNA sequence design method on the basis of multi-objective genetic algorithm. Alignments and secondary structures predicted by our system can give useful information for RNA-RNA interaction prediction. Moreover, our RNA sequence design method can be applied to RNA device design problems which are difficult for the other previous RNA sequence design methods.
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多目的最適化によるRNA配列解析
多目标优化的 RNA 序列分析
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yasuda, M., et.al., 種田晃人]
通讯作者:
種田晃人
構造変化を伴う機能性RNAの配列設計
具有结构变化的功能RNA的序列设计
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Koike K, Fukami K, Yonemoto K, Iwatani R, Obara N, Ueda K, Toyonaga M, Ueda S, Ohara A, Takeda K, Yamagishi S, Okuda S, 荒木由布子, 種田晃人]
通讯作者:
種田晃人
DOI:
10.3389/fgene.2012.00036
发表时间:
2012
期刊:
Frontiers in genetics
影响因子:
3.7
作者:
[Taneda A]
通讯作者:
Taneda A
A multi-objective evolutionary algorithm for RNA sequence design
RNA序列设计的多目标进化算法
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Hamada, M., Sato, K., Asai, K., 種田晃人]
通讯作者:
種田晃人
MODENA: a multi-objective RNA inverse folding
MODENA:多目标RNA反向折叠
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
Advances and Applications in Bioinformatics and Chemistry
影响因子:
--
作者:
[A. Taneda]
通讯作者:
A. Taneda
共 8 条
Bioinformatic study on functional RNAs with a conformational change
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批准号:24500358
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.41万
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财政年份:2012
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负责人:TANEDA Akito
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依托单位:
Genome scale prediction of eukaryotic pseudoknotted non-coding RNAs
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批准号:19700272
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.18万
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财政年份:2007
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负责人:TANEDA Akito
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依托单位: