Analysis of the proteins possessed by the last common ancestor and the organisms present before it

分析最后一个共同祖先及其之前存在的生物体所拥有的蛋白质

• 批准号: 23370097
• 负责人: YAMAGISHI Akihiko
• 金额: $ 6.49万
• 依托单位: Tokyo University of Pharmacy and Life Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-11-18 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23370097/
• 关键词: 生命初期進化; 共通祖先; コモノート; NDK; 分子系統樹; タンパク質耐熱性; 酵素活性; アミノ酸単純化; 古細菌; 真正細菌; アミノ酸少数化

We have resurrected the gene of the nucleotidediphosphate kinase (NDK) possessed by the common ancestor of Bacteria and Archaea, and analyzed the thermal stability of the protein produced from the resurrected genes. The ancestral NDKs showed stability close to 110 degree C, suggesting the common ancestors of Bacteria and Archaea were thriving at the temperature between 80 and 100 degree C. The NDK of the last common ancestor, commonote, was also resurrected and reproduced. The ancestral NDK showed the high stability, suggesting that the commonote were living at 75 degree C or higher temperature. The ancestral NDKs from which one of the 20 amino acid species were removed, were produced and whose stability and activity were analyzed. The results showed the amino acid species that is not absolutely required for the stability and activity.

我们复活了细菌和古细菌共同祖先所拥有的核苷酸二磷酸激酶（NDK）基因，并分析了复活基因产生的蛋白质的热稳定性。祖先NDK在接近110摄氏度时表现出稳定性，这表明细菌和古细菌的共同祖先在80至100摄氏度之间的温度下繁衍生息。最后一个共同祖先commonote的NDK也复活并繁殖。祖先NDK表现出较高的稳定性，表明普通动物生活在75摄氏度或更高的温度下。 生产了去除了 20 种氨基酸之一的祖先 NDK，并分析了其稳定性和活性。结果表明，氨基酸种类对于稳定性和活性来说并不是绝对必需的。

项目成果

全生物の共通祖先遺伝子の復元

重建所有生物的共同祖先基因

• 发表时间: 2014
• 期刊: バイオサイエンスとインダストリー
• 作者: 赤沼哲史;山岸明彦
• 通讯作者: 山岸明彦

遺伝暗号の起源

遗传密码的起源

• 发表时间: 2013
• 作者: Naito;Y.I.;Y. Chikaraishi;N. Ohkouchi;and M. Yoneda;高田慎治;Kazuho Ikeo;Suzuki R. and Saitou N;赤沼哲史
• 通讯作者: 赤沼哲史

全生物の共通祖先以前のコドンの進化

所有生物共同祖先之前密码子的进化

• 发表时间: 2012
• 作者: 赤沼哲史;島田真実;篠崎梢;中島慶樹;横堀伸一;山岸明彦
• 通讯作者: 山岸明彦

古代遺伝子の復元による祖先生物の生育温度の推定

通过重建远古基因估算祖先生物的生长温度

• 发表时间: 2012
• 作者: 赤沼哲史;中島慶樹;島田真実;横堀伸一;山岸明彦
• 通讯作者: 山岸明彦

全生物共通祖先の遺伝子を再現する

复制所有生物共同祖先的基因

• 发表时间: 2012
• 作者: 半谷吾郎;宮田晃江;好廣眞一;高畑由起夫;古市剛史; 栗原洋介; 早石周平;Babarinde I.;福重春菜;内田友里亜;山岸明彦
• 通讯作者: 山岸明彦