Evolution of Eye as sensory organ

眼睛作为感觉器官的进化

基本信息

  • 批准号:
    23370098
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 12.15万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 财政年份:
    2011
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2011-04-01 至 2014-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

To understand the process and origin of various eyes, I conducted comparative evolutionary study by using next generation sequence technology. For the purpose, I took two different types of Jellyfish with and without eye and also dinoflagellate with different types of lens eye. RNA-seq by next generation sequence technology performed collection of gene expression profiles of the species. The visual pigment of dinoflagellate showed the similarity with bacterial pigment and it suggests the origin of their eye-like structure related to bacterial origin. The other side, the result of jellyfish showed the molecules related their lens development evolutionaliry related with our genes, thus, jellyfish already gain molecular system for lens conformation before establishing nervous system. Now, we still continue more fine analysis of the data.
为了了解各种眼睛的形成过程和起源,我利用下一代序列技术进行了比较进化研究。为此,我取了两种不同类型的水母,有眼睛和没有眼睛,也取了不同类型的水晶体眼睛的鞭毛藻。下一代测序技术RNA-seq采集了该物种的基因表达谱。鞭毛藻的视觉色素与细菌色素具有相似性,提示其眼状结构的起源与细菌起源有关。另一方面,水母的研究结果表明,与晶状体发育相关的分子进化与我们的基因有关,因此,水母在建立神经系统之前就已经获得了晶状体构象的分子系统。现在,我们仍在继续对数据进行更精细的分析。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genome wide data analysis by using NGS
使用 NGS 进行全基因组数据分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Masataka UENO;Kazunori YAMADA;Masayuki NAKAMICHI;Kazuho Ikeo
  • 通讯作者:
    Kazuho Ikeo
Gene duplication and diversity of species.
基因复制和物种多样性。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Akiyama-Oda. Y. and Oda;H.;Kazuho Ikeo
  • 通讯作者:
    Kazuho Ikeo
Whole-exome sequencing identifies a novel ALMS1 mutation (p.Q2051X) in two Japanese brothers with Alström syndrome.
全外显子组测序在两名患有阿尔斯特罗姆综合征的日本兄弟中发现了一种新的 ALMS1 突变 (p.Q2051X)。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.2
  • 作者:
    Katagiri S;Yoshitake K;Akahori M;Hayashi T;Furuno M;Nishino J;Ikeo K;Tsuneoka H;Iwata T.
  • 通讯作者:
    Iwata T.
Computational Tools for NGS Data Analysis
NGS 数据分析的计算工具
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    竹中基裕;前田享史;岸野慎太朗;Kazuho Ikeo
  • 通讯作者:
    Kazuho Ikeo
Longitudinal clinical course of three Japanese patients with Leber congenital amaurosis/early-onset retinal dystrophy with RDH12 mutation
  • DOI:
    10.1007/s10633-014-9436-z
  • 发表时间:
    2014-06-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    1.4
  • 作者:
    Kuniyoshi, Kazuki;Sakuramoto, Hiroyuki;Iwata, Takeshi
  • 通讯作者:
    Iwata, Takeshi
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