Development of ultra-fast comparison method of protein local structures towards the prediction of ligand-binding sites

开发蛋白质局部结构的超快速比较方法以预测配体结合位点

• 批准号: 23500374
• 负责人: TOMII KENTARO
• 金额: $ 3.41万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-04-28 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23500374/
• 关键词: タンパク質; 基質結合部位; 機能部位; 低分子医薬品; 低分子化合物; データベース

项目成果

PoSSuM: a database of known and potential ligand-binding sites in proteins

PoSSuM：蛋白质中已知和潜在配体结合位点的数据库

• 发表时间: 2012
• 作者: J. Ito;Y. Tabei;K. Shimizu;K. Tsuda;K. Tomii
• 通讯作者: K. Tomii

PoSSuM: a database for searching similar pairs of known and potential ligand-binding sites in proteins

PoSSuM：用于搜索蛋白质中相似的已知和潜在配体结合位点对的数据库

• 发表时间: 2012
• 作者: J. Ito;Y. Tabei;K. Shimizu;K. Tsuda;K. Tomii
• 通讯作者: K. Tomii

PoSSuM

PoSSuM

機能解析のためのタンパク質基質結合可能部位の網羅的比較解析

蛋白质底物结合位点的全面比较分析以进行功能分析

• 发表时间: 2012
• 作者: Ryota Miyata;Keisuke Ota;Toru Aonishi;富井健太郎
• 通讯作者: 富井健太郎

Pdb-wide discovery of similar ligand binding sites Using structural sketches

使用结构草图在 Pdb 范围内发现相似的配体结合位点

• 发表时间: 2011
• 作者: J. Ito;Y. Tabei;K. Shimizu;K.Tomii;K. Tsuda
• 通讯作者: K. Tsuda