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Engineerability of a functional ribonucleoprotein complex

功能性核糖核蛋白复合物的工程化

基本信息

批准号：
23550190
负责人：
HARADA Kazuo
金额：
$ 3.33万
依托单位：
Tokyo Gakugei University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011 至 2013
项目状态：
已结题

项目摘要

In order to understand the molecular basis for ribonucleoprotein (RNP) structure and function, we attempted the engineering of the interactions and the spatial organization of the N antitermination complex. Relatively small changes in the spatial orientation of the RNA site have been shown to result in large changes in antitermination activity. We found that it is possible to partially recover activity lost upon altering the orientation of the core HIV RRE site within the antitermination complex by simultaneously modifiyng the orientation of RNA elements and N protein domains. We also showed that optimization of the interaction of N protein with NusA and RNA polymerase lead to a partial recovery of antitermination activity. The results show that the spatial orientation of the core interaction within the antitermination complex can be engineered in a rational manner, demonstrating the engineerability of ribonucleoprotein complexes.

为了了解核糖核蛋白(RNP)结构和功能的分子基础，我们尝试了N抗终止复合体的相互作用和空间组织的工程。RNA位置的空间取向的相对较小的变化已被证明导致抗终止活性的较大变化。我们发现，通过同时改变RNA元件和N蛋白结构域的方向，可以部分恢复因改变抗终止复合体中核心HIV RRE位点的方向而失去的活性。我们还表明，优化N蛋白与NusA和RNA聚合酶的相互作用可以部分恢复抗终止活性。结果表明，反终止复合体中核心相互作用的空间取向可以被合理地设计，从而证明了核糖核蛋白复合体的工程化。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

“Tailor-made RNAs: from self-folding RNAs to ribonucleoproteins”, in RNA Nanotechnology, B. Wang, Ed.

“定制 RNA：从自折叠 RNA 到核糖核蛋白”，《RNA 纳米技术》，B. Wang，Ed。

DOI：
发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
0
作者：
R. Mashiko;Y. Nakazawa;M. Kusakari;B. Hatano;S. Murakami;T. Kijima;上森隆裕，松本健司，小澤智宏，米村俊昭;松井敏高;Kazuo Harada
通讯作者：
Kazuo Harada

Analysis of the HIV Rev-RRE complex using a bacterial reporter assay

使用细菌报告基因检测分析 HIV Rev-RRE 复合物

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
Satoshi Tanamura;Hiroto Terakado and Kazuo Harada
通讯作者：
Hiroto Terakado and Kazuo Harada

Engineerability of a functional ribonucleoprotein complex

功能性核糖核蛋白复合物的工程化

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kimura;Y.;Inada;Y.;Numata;T.;Arikawa;T.;Li;Y.;Zhang;J.-P.;Wang(Otomo);Z.-Y. & Ohno;T.;米村俊昭・藤原啓介;Kazuo Harada
通讯作者：
Kazuo Harada

Engineering the spatial orientation of a core RNA-peptide interaction within a functional ribonucleoprotein complex

设计功能性核糖核蛋白复合物内核心 RNA-肽相互作用的空间方向