Analysis of interaction that facilitated thermo-adaptive evolution of E. coli

促进大肠杆菌热适应性进化的相互作用分析

• 批准号: 23570277
• 负责人: KISHIMOTO Toshihiko
• 金额: $ 3.41万
• 依托单位: Toho University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23570277/
• 关键词: 相互作用; 実験室進化; 大腸菌; 高温適応進化; 応答解析; 発現解析

Interaction facilitating growth at high temperature was analyzed by identify of interactor, transcriptome and mutation function analyses. We have identified lactic acid as candidate for major interactor, but we have found that lactic acid production pathway was not activated significantly during thermo-adaptive evolution by transcriptome analyses, and lactate permease gene, lldP, was mutated in late 45 degree adaptation period when interaction diminished.Six mutations fixed during early 45 degree adaptation were analyzed by estimating contribution to fitness at 45 degree. We found candidate mutations important for interaction appearance and disappearance. These candidate mutations were related to cellular protein stability. This study indicated that interaction facilitating growth at high temperature was achieved by combination of interactor and intracellular protein stability.

通过相互作用子鉴定、转录组和突变功能分析，分析了相互作用对高温生长的促进作用。我们已经确定乳酸是主要相互作用的候选物质，但通过转录组分析，我们发现乳酸产生途径在热适应进化过程中没有明显激活，乳酸渗透酶基因lldP在45度适应期后期发生突变，相互作用减弱。通过估算45度适应度的贡献，分析了在45度适应早期固定的6个突变。我们发现候选突变对相互作用的出现和消失很重要。这些候选突变与细胞蛋白稳定性有关。本研究表明，相互作用促进高温生长是通过相互作用物与细胞内蛋白稳定性的结合实现的。

项目成果

高温適応進化でみられる高変異率下での変異蓄積メカニズムの解析

高温适应性进化中观察到的高突变率下的突变累积机制分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 岸本利彦;染谷有紀;花神彩香;小林日沙香;四方哲也
• 通讯作者: 四方哲也

大腸菌の耐熱進化時に見られる相互作用の解析

大肠杆菌耐热性进化过程中观察到的相互作用分析

• 发表时间: 2011
• 作者: Zhang;L.;Chen;J.;Mori;T.;Yan;Y.;Liu;W.;Abe;I.;小宅綾菜,山内長承,岸本利彦,四方哲也
• 通讯作者: 小宅綾菜,山内長承,岸本利彦,四方哲也

疑似進化による新規的表現型の獲得

通过伪进化获得新的表型

• 发表时间: 2012
• 作者: 應ベイウェン;本田朋也;吉田真理;岸本利彦;津留三良;四方哲也
• 通讯作者: 四方哲也

山内翔偉・渡邊総一郎二環系シクロブタノン誘導体のフッ素化反応

Shohei Yamauchi 和 Soichiro Watanabe 双环环丁酮衍生物的氟化反应

• 发表时间: 2012
• 作者: Migita;K. Tokui;M. Hirakoba;K;安達 登;松田典子,岡田明;山内翔偉・渡邊総一郎
• 通讯作者: 山内翔偉・渡邊総一郎

大腸菌耐熱進化時に現れる相互作用を仲介する分子の探索

寻找介导大肠杆菌耐热性进化过程中出现的相互作用的分子

• 发表时间: 2011
• 作者: 大野浩平;岸本利彦;小宅綾菜;四方哲也;渡邊総一郎
• 通讯作者: 渡邊総一郎