Narrowing the genomic regions responsible for sex determination in spinach

缩小菠菜性别决定的基因组区域

• 批准号: 23580001
• 负责人: ONODERA Yasuyuki
• 金额: $ 3.33万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23580001/
• 关键词: 植物育種; F1ハイブリッド; 性決定遺伝子; 雌雄異株; 性染色体; 遺伝

Spinach is widely known to be dioecious. However, monoecious plants can also occur in this species. Sex expression in dioecious spinach plants is controlled by a single gene pair termed X and Y. Our previous study showed that a single, incompletely dominant gene, which controls the monoecious condition, is linked to X/Y.The four Y-linked AFLP markers developed in this study were converted into sequence-characterized amplified region (SCAR) markers. Linkage analysis using the four SCAR markers and three already-known Y-linked markers suggested that recombination is suppressed around the male-determining gene (Y). Analysis of spinach genomic BAC clones isolated with the Y-linked markers suggested that the male-specific (non-recombining) region is at least larger than 840 kbp. Further, most part of this chromosomal region was found to be accounted for by interspersed repeated elements, e.g. retroposons, while only a few protein-coding genes were identified in this region.

众所周知，菠菜是雌雄异株的。然而，雌雄同株的植物也可以出现在本种中。菠菜雌雄异株植株的性别表达受一对基因X和Y控制。我们先前的研究表明，控制雌雄异株的单个不完全显性基因与X/Y连锁。本研究中开发的四个Y连锁AFLP标记被转化为序列特征扩增区(SCAR)标记。使用四个SCAR标记和三个已知的Y连锁标记进行的连锁分析表明，男性决定基因(Y)周围的重组受到抑制。对用Y连锁标记分离的菠菜基因组BAC克隆的分析表明，雄性特异(非重组)区域至少大于840kbp。此外，该染色体区域的大部分被散布的重复元件所占据，例如逆转录子，而在该区域中只发现了少数编码蛋白质的基因。

项目成果

ホウレンソウにおける雄特異的ゲノム領域の構造解析

菠菜雄性特异性基因组区域的结构分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 安達登;篠田謙一;梅津和夫;安達登;安達 登;香月遼・川崎翔太・山下祐佳・塚本知玄・喜多村啓介・阿部純・山田哲也;南縁・渡邊総一郎;安達 登 他;織田裕二・小野寺康之・豊田敦・山本将之・三上哲夫
• 通讯作者: 織田裕二・小野寺康之・豊田敦・山本将之・三上哲夫

Spinacia属から見出された同型および異型性染色体のFISH法による特徴付け

通过 FISH 方法表征菠菜属中发现的同型和异型染色体

• 发表时间: 2014
• 作者: 澤田純明;平田和明;香月遼・川崎翔太・山下祐佳・塚本知玄・喜多村啓介・阿部純・山田哲也;藤戸聡史・鈴木伶実・星野洋一郎・近江戸伸子・小野寺康之
• 通讯作者: 藤戸聡史・鈴木伶実・星野洋一郎・近江戸伸子・小野寺康之

ホウレンソウにおける雄性および間性を支配する遺伝子の対立性検定

控制菠菜雄性和间性基因的等位基因测试

• 发表时间: 2013
• 作者: Bei-Wen Ying;Saburo Tsuru;Tetsuya Yomo.;澤田純明;森芳弘・丸山伸之・阿部純・山田哲也;小野寺康之・織田祐二・山本和輝・長谷田茜・藤戸聡史・三上哲夫
• 通讯作者: 小野寺康之・織田祐二・山本和輝・長谷田茜・藤戸聡史・三上哲夫

Molecular evidence that the genes for dioecism and monoecism in Spinacia oleracea L. are located at different loci in a chromosomal region

• DOI: 10.1038/hdy.2013.112
• 发表时间: 2013-10
• 期刊: Heredity
• 影响因子: 3.8
• 作者: Ken Yamamoto;Y. Oda;A. Haseda;S. Fujito;T. Mikami;Y. Onodera

pinacia属における分子系統学的解析および異型性染色体の探索

松属植物分子系统发育分析及异型染色体搜寻

• 发表时间: 2014
• 作者: 花神彩香;赤神慶子;岸本利彦;四方哲也;鈴木伶実・藤戸聡史・星野洋一郎・小野寺康之
• 通讯作者: 鈴木伶実・藤戸聡史・星野洋一郎・小野寺康之