Analysis on allergenic 13S globulin subunits of buckwheat

荞麦致敏13S球蛋白亚基分析

• 批准号: 23580020
• 负责人: TANAKA Tomoyuki
• 金额: $ 3.41万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23580020/
• 关键词: ソバ; 13Sグロブリン; 反復配列

Buckwheat genomic DNA library, consisting of 142,005 clones, was screened to elucidate the diversity of 13S globulin genes. Twenty-six BAC clones were isolated and 17 genes of 13S globulin were identified, the sequences of which were deposited into DNA Data Bank of Japan. The unit length of nucleotides for most tandem repeat sequences, which are specifically inserted into alpha polypeptides of 13S globulin, was 45 bp while that of some repeats had extra three nucleotides like CGG or AGA, resulting in different secondary structure formation. On the other hand, preliminary experimental system was developed to analyze the effect of environmental factors on 13S globulin composition using autogamous tartary buckwheat.

对荞麦基因组DNA文库进行了142，005个克隆的筛选，以阐明13S球蛋白基因的多样性。分离到26个BAC克隆，鉴定出17个13S球蛋白基因，并将其序列存入日本DNA数据库。大多数串联重复序列的核苷酸单位长度为45 bp，而某些重复序列的核苷酸单位长度多出3个核苷酸，如CGG或阿加，导致二级结构的形成不同。另一方面，以自花授粉的苦荞麦为材料，初步建立了分析环境因子对苦荞麦13S球蛋白组成影响的实验体系。

项目成果

Methods in Molecular Boilogy, vol. 984, N. Volpi and F. Maccari (Eds.), Capillary Electrophoresis of Biomolecules, Capillary electrophoresis of seed strage proteins : the separation and identification of microheterogeneous rice glutelin subunits

分子生物学方法，卷。

• 发表时间: 2013
• 作者: T. Katsube-Tanaka;N. Khan;Y. Takahashi;M. Nakagawa.;Katsube-Tanaka T
• 通讯作者: Katsube-Tanaka T

"反復配列を持たない13Sグロブリン"を低減化したソバ個体の育成-0回反復サブユニットの遺伝子識別技術の開発-

降低“无重复序列13S球蛋白”含量的荞麦植物的培育 - 0重复亚基基因鉴定技术的开发 -

• 发表时间: 2014
• 期刊: 作物研究
• 作者: 高橋亘;高溝正;鄭亜紀子・斎藤達也・近藤哲也;鄭亜紀子・斎藤達也・近藤哲也;田中朋之・中川真梨子・佐野まどか・安井康夫
• 通讯作者: 田中朋之・中川真梨子・佐野まどか・安井康夫

“反復配列を持たない13Sグロブリン遺伝子”を欠失したソバ個体の探索

寻找缺乏“无重复序列的13S球蛋白基因”的荞麦植物

• 发表时间: 2013
• 作者: T. Katsube-Tanaka;M. Sano;M. Nakagawa;Y. Yasui;佐野まどか・中川真梨子・安井康夫・田中朋之;田中朋之・中川真梨子・佐野まどか・安井康夫
• 通讯作者: 田中朋之・中川真梨子・佐野まどか・安井康夫

ソバ13S グロブリン遺伝子の多様性評価

荞麦13S球蛋白基因多样性评估

• 发表时间: 2013
• 作者: T. Katsube-Tanaka;M. Sano;M. Nakagawa;Y. Yasui;佐野まどか・中川真梨子・安井康夫・田中朋之
• 通讯作者: 佐野まどか・中川真梨子・安井康夫・田中朋之

Allergenic protein, 13S globulin, of common buckwheat diversified by the insertion of tandem repeat

普通荞麦的过敏蛋白 13S 球蛋白通过插入串联重复序列而多样化

• 发表时间: 2013
• 作者: Khan;N.;Takahashi;Y.;Katsube-Tanaka;T;田中朋之・中川真梨子・佐野まどか・安井康夫;T. Katsube-Tanaka
• 通讯作者: T. Katsube-Tanaka