权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

段階的超分子形成を利用したDNA四重鎖の構造制御

使用逐步超分子形成对 DNA 四链体进行结构控制

基本信息

批准号：
11J09031
负责人：
犬飼章恵
金额：
$ 0.83万
依托单位：
Nara Institute of Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011 至 2012
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11J09031/
关键词：
カルバゾール DNA DNA四重鎖酵素活性

项目摘要

昨年度までに、イミダゾール部位をカチオン化することによって水溶化させたカルバゾール誘導体(Im^+)_2Czと二本鎖DNAとして広く用いられるCalf Thymus(ct-)DNAとの複合化を見出している。形成する複合体について吸収、CDスペクトル測定を始めとした各種分光分析により検討を行い、DNAと(Im^+)_2Czとで形成する複合体の予想構造及び形成メカニズムを明らかにした。本年度は、形成する二種類の複合体についてNMR測定や質量分析を行い、形成する構造についての考察を行った。また、エチルカルバゾールの3,6位から三重結合を介してイミダゾリウムを連結させている(Im^+)_2Czをモデル分子として、参照化合物を合成し、それぞれ(ct-)DNAとの相互作用について検討を行った。参照化合物としては、エチル基より長いアルキル基である(S)-2メチルブチル基を導入した、カチオン性キラルカルバゾール誘導体[c-(IM^+)_2Cz]および、イミダゾリウム導入位置をカルバゾールの2,7位に変更した[2,7-(Im^+)_2Cz]を参照化合物として合成した。これらふたつの参照化合物においては(Im^+)_2Czと同様に、DNAの濃度変化に応答した二段階の構造体形成が確認された。以上の結果から、(Im^+)_2Czのような、高い水溶性を持たず、カルバゾール骨格とイミダゾリウムを三重結合で連結する構造をもつカチオン性分子は、DNAと二段階で構造体を形成することが示された。一方で、(Im^+)_2CzはDNA四重鎖とは一段階で複合体を形成し、DNA二重鎖の場合とは異なり、単一の結合状態を有することが分かった。このことから(Im^+)_2Czは複合体形成の様式の違い(一段階及び二段階)によって、二重鎖と四重鎖を区別して識別することの出来る全く新しいプローブとして機能することがわかった。

Yesterday's までに、イミダゾール Parts をカチオン化することによってWater-soluble させたカルバゾールinducing body(Im^+)_2Czと二本 lockDNAとして広く用いられるCalf Thymus(ct-)DNA is complexed and shown. Formation of complex complex, absorption, CD measurement, various spectroscopic analysis, DNA と(Im^+)_2Cz is the ideal structure of the する complex and the びびカニズムを明らかにした. This year, the NMR measurement and mass analysis of the two types of complexes that were formed were carried out, and the formation and structure of the two types of complexes were inspected and carried out.また, エチルカルバゾールの3, 6-bit から triple combination を Introduction してイミダゾリウムをconnection させている(Im^+)_2 Czをモデルmolecule として, reference compound をsynthesis し, それぞれ(ct-)DNA とのinteraction について検question を行った. Reference compounds: Tetrafluoroethylene, Tetrafluoroethylene Tetracycline (S)-2メチルThe introduction of ブチルをした, カチオン性キラルカルバゾール inducer [c-(IM^ +)_2Cz]および、イミダゾリウム import positionをカルバゾールの2,7 The reference compound として was synthesized using に変聗た[2,7-(Im^+)_2Cz].これらふたつのReference compound においては(Im^+)_2Czと同様に, DNA concentration change に応 Answer したtwo-stage structure formation がconfirmation された. The results of the above are から, (Im^+)_2Czのような, high water-solubility をholding たず, カルバゾールとイミダゾリウThe three-fold bonding structure of the する structure すもつカチオンsexual molecule は, DNA and the two-stage structure をform the することが Show された. One side, (Im^+)_2Cz is a DNA quadruple lock, a first-stage complex is formed, a DNA double lock is a different occasion, and a single combined state is present. The このことから(Im^+)_2Czは complex forms the の様style のviolation (one stage and the second stage) によって, 2 Heavy lock and quadruple lock を difference して identification することのcome out る全く新しいプローブとしてfunction することがわかった.