Evolution of adaptive trraits to climate change in a wild relative of Arabidopsis thaliana distributed along wide altitudinal ranges.

分布于广泛海拔范围的拟南芥野生近缘种对气候变化的适应性特征的演变。

基本信息

批准号：
23770016
负责人：
HIRAO Akira
金额：
$ 2.91万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011 至 2013
项目状态：
已结题

项目摘要

Genetic variation along environmental gradients such as altitude provides understanding to genetic basis of adaptive evolution. Arabidopsis kamchatica subsp. kamchatica, a wild relative of A. thaliana, occurs along wide altitudinal gradients. In this study, we took advantage of the wide altitudinal distribution of A. kamchatica to detect the genetic basis of local adaptation. The results of screening on eight candidate genes by next generation sequencing indiicate that GL1, a trichome gene, and PHYB, a photorecetor gene, are under natural selection and are associated with altitudinal adaptation.

沿环境梯度（例如高度）的遗传变异为适应性进化的遗传基础提供了理解。拟南芥kamchatica亚种。 Kamchatica是A. thaliana的野生亲戚，发生在广泛的海拔梯度上。在这项研究中，我们利用了甘察番茄的广泛高度分布来检测局部适应的遗传基础。通过下一代测序对八个候选基因进行筛选的结果，表明GL1（Trichome Gene和Phyb（Photorecetor基因）是自然选择的，并且与高度适应有关。

项目成果

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わが国の高山植物の遺伝的多様性と脆弱性－温暖化条件下で氷期遺存種の南限集団が示すこと－

日本高山植物的遗传多样性和脆弱性 - 冰河时代残余物种最南端种群在变暖条件下的表现 -

DOI：
发表时间：
2014
期刊：
地球環境
影响因子：
0
作者：
池田啓;小泉逸郎;平尾章
通讯作者：
平尾章

標高万能植物ミヤマハタザオの環境適応遺伝子：トライコームと光受容体

高原适应性植物 Miyamaha tazao 的环境适应基因：毛状体和光感受器

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
Ueda;S.;Okubo;T.;Itioka;T.;Shimizu-kaya;U.;Yago;M.;Inui;Y. and Itino;T.;*鶴井香織・本間淳・西田隆義;鈴木亮・金井隆治・正木大祐;平尾章・恩田義彦・清水(稲継）理恵・瀬々潤・清水健太郎・田中健太
通讯作者：
平尾章・恩田義彦・清水(稲継）理恵・瀬々潤・清水健太郎・田中健太

標高万能植物ミヤマハタザオにおけるトライコームおよび光受容体遺伝子の集団間分化

高原适应性植物 Miyamaha tazao 毛状体和光感受器基因的群体间分化

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
Ueda;S.;Okubo;T.;Itioka;T.;Shimizu-kaya;U.;Yago;M.;Inui;Y. and Itino;T.;*鶴井香織・本間淳・西田隆義;鈴木亮・金井隆治・正木大祐;平尾章・恩田義彦・清水(稲継）理恵・瀬々潤・清水健太郎・田中健太;平尾章・恩田義彦・清水(稲継）理恵・瀬々潤・清水健太郎・田中健太
通讯作者：
平尾章・恩田義彦・清水(稲継）理恵・瀬々潤・清水健太郎・田中健太

Impact of Global Warming on Mountain and Polar Ecosystems: What Have Artificial Warming Experiments Told?

全球变暖对山区和极地生态系统的影响：人工变暖实验告诉我们什么？

DOI：
10.5026/jgeography.122.628
发表时间：
2013
期刊：
Journal of Geography (Chigaku Zasshi)
影响因子：
0
作者：
Hosoya;T.;Hosaka;K.;Saito;Y.;Degawa,Y. & Suzuki;R;鶴井香織,高橋佑磨,森本元;田中健太・平尾章・鈴木亮・飯島慈裕・浜田崇・尾関雅章・廣田充
通讯作者：
田中健太・平尾章・鈴木亮・飯島慈裕・浜田崇・尾関雅章・廣田充

Screening for diversifying selection on six flowering and hervivory-defence genes among 19 natural populations of Arabidopsis kamchatica : from pooled-DNA analysis with parallel sequencing

拟南芥 19 个自然种群中 6 个开花和生存防御基因的多样化选择筛选：来自平行测序的混合 DNA 分析