Elucidation of the oligomerization mechanism of pore forming protein

阐明成孔蛋白的寡聚机制

• 批准号: 23780107
• 负责人: GODA Shuichiro
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Nagasaki University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23780107/
• 关键词: タンパク質工学; 蛋白質; タンパク質; 生体分子; 糖鎖

Pore forming proteins form oligomer on the surface of the cell. Then, they form an ion permiable pore to disrupt the cells. In this reseach, structural changes in oligomerization and oligomeric stucture of the pore forming proteins were measured by small-angle X-ray scattering (SAXS) and crystal X-ray diffraction. A hemolytic lectin from marine invertebrate Cucumaria echinata (CEL-III) forms heptamer at first then three heptamers form 21-mer and 21-mer dissociated to heptamer in the presence of detergent by the results of SAXS measurements. CEL-III oligomer was crystallized and X-ray diffraction data were collected. Crystals diffracted X-rays to 3.3 and 4.2 A resolution using synchrotron radiation.

孔形成蛋白在细胞表面形成寡聚体。然后，它们形成一个离子渗透孔来破坏细胞。本研究利用小角X射线散射（SAXS）和晶体X射线衍射（XRD）技术，对孔形成蛋白的寡聚化和寡聚体结构的变化进行了研究。小角X射线散射（SAXS）结果表明，海洋无脊椎动物刺瓜（Cucumaria echinata，CEL-III）的溶血凝集素首先形成七聚体，然后三个七聚体形成21聚体，21聚体在去污剂存在下解离为七聚体。将CEL-III低聚物结晶并收集X射线衍射数据。晶体衍射X射线到3.3和4.2 A分辨率使用同步辐射。

项目成果

Crystallization and preliminary crystallographic study of oligomers of the haemolytic lectin CEL-III from the sea cucumber Cucumaria echinata

海参溶血凝集素 CEL-III 低聚物的结晶和初步晶体学研究

• DOI: 10.1107/s1744309113004065
• 发表时间: 2013
• 期刊: Acta Crystallographica Section F
• 作者: Hideaki Unno;Keigo Hisamatsu;Tomonao Nagao;Yuki Tateya;Naoki Matsumoto;Shuichiro Goda;and Tomomitsu Hatakeyama
• 通讯作者: and Tomomitsu Hatakeyama

溶血性レクチンの多量体化機構のX線小角散乱法による解析

小角X射线散射法分析溶血凝集素多聚机制

• 作者: Masahiro Nakajima;Tetsuro Yamashita;Machiko Takahashi;Yuki Nakano;Takumi Takeda;郷田秀一郎
• 通讯作者: 郷田秀一郎

サンゴ由来レクチン相同性タンパク質の糖特異性の解明

阐明珊瑚源凝集素同源蛋白的糖特异性

• 发表时间: 2013
• 作者: 工藤 彰洋;牛島 佑樹;海野 英昭;畠山 智充;郷田 秀一郎
• 通讯作者: 郷田 秀一郎

糖鎖付加デンドリマーを用いたレクチン活性測定法の開発

开发使用糖基化树枝状聚合物的凝集素活性测量方法

• 发表时间: 2011
• 作者: 橋口 拓勇;榊原 陽一;下平 武彦;黒木 勝久;Ming-cheh Liu;水光 正仁;狩野良太,海野英昭,郷田秀一郎,畠山智充
• 通讯作者: 狩野良太,海野英昭,郷田秀一郎,畠山智充

Analysis of the structural change of the pore forming toxin by stopped-flow small-angle X-ray scattering

停流小角X射线散射分析成孔毒素的结构变化

• 发表时间: 2012
• 作者: 大栗誉敏;中村仁美;千々岩崇仁;大野素徳;上田直子;伊福 健太郎;Shuichiro Goda
• 通讯作者: Shuichiro Goda