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Genome analysis of bacteriophage toward botulinum neurotoxin-transfer mechanism

噬菌体对肉毒杆菌神经毒素转移机制的基因组分析

基本信息

批准号：
23790479
负责人：
SAKAGUCHI Yoshihiko
金额：
$ 2.75万
依托单位：
University of Miyazaki
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011 至 2012
项目状态：
已结题

项目摘要

Phage c-st is typical Clostridium botulinumtype C neurotoxin-converting phage. Although the phage c-st genome has been sequenced, no much information is available in its biology and genome. To extend our understanding of horizontal gene transfer by this phage, we investigated in the core genome of phage c-st. First, analyzing the phage structural proteins, the genome module for the structural proteins was 98.5-157.5 kbp of phage c-st genome. Second, comparing the genome of phage c-st with that of a related phage c-468, the 43-57 kbp and 116.5-123 kbp of phage c-st genome were very similar to phage 468 genome. Third, the essential genes for phage genome partitioning were revealed to be located 175.5-178.5 kbp of phage c-st genome. According to these results, I speculated that the core genome was the 1-43 kbp, 57-116.5 kbp, and 123-186 kbp regions of phage c-st genome.

噬菌体c-st是典型的肉毒梭菌C型神经毒素转化噬菌体。虽然噬菌体c-st基因组已经测序，但在其生物学和基因组方面没有太多信息。为了加深对该噬菌体水平基因转移的理解，我们研究了噬菌体c-st的核心基因组。首先，分析了噬菌体结构蛋白，结构蛋白的基因组模块为噬菌体c-st基因组的98.5- 157.5kbp。第二，将噬菌体c-st的基因组与一个相关的噬菌体c-468的基因组进行比较，发现噬菌体c-st的43-57 kbp和116.5-123 kbp的基因组与噬菌体468的基因组非常相似。第三，噬菌体基因组分配所必需的基因位于噬菌体c-st基因组的175.5- 178.5kbp处。根据这些结果，我推测核心基因组是噬菌体c-st基因组的1-43 kbp，57-116.5 kbp和123-186 kbp区域。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Phospholipase C produced by Clostridium botulinum types C and D: comparison of gene, enzymatic, and biological activities with those of Clostridium perfringens alpha-toxin.

C 型和 D 型肉毒梭菌产生的磷脂酶 C：与产气荚膜梭菌 α 毒素的基因、酶活性和生物活性的比较。

DOI：
发表时间：
2013
期刊：
Acta Medica Okayama
影响因子：
0.5
作者：
Ni Nengah Dwi Fatmawati;Y. Sakaguchi;T. Suzuki;M. Oda;K. Shimizu;Y. Yamamoto;J. Sakurai;O. Matsushita and K. Oguma
通讯作者：
O. Matsushita and K. Oguma

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