Genome analysis of bacteriophage toward botulinum neurotoxin-transfer mechanism

噬菌体对肉毒杆菌神经毒素转移机制的基因组分析

基本信息

  • 批准号:
    23790479
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.75万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 财政年份:
    2011
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2011 至 2012
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Phage c-st is typical Clostridium botulinumtype C neurotoxin-converting phage. Although the phage c-st genome has been sequenced, no much information is available in its biology and genome. To extend our understanding of horizontal gene transfer by this phage, we investigated in the core genome of phage c-st. First, analyzing the phage structural proteins, the genome module for the structural proteins was 98.5-157.5 kbp of phage c-st genome. Second, comparing the genome of phage c-st with that of a related phage c-468, the 43-57 kbp and 116.5-123 kbp of phage c-st genome were very similar to phage 468 genome. Third, the essential genes for phage genome partitioning were revealed to be located 175.5-178.5 kbp of phage c-st genome. According to these results, I speculated that the core genome was the 1-43 kbp, 57-116.5 kbp, and 123-186 kbp regions of phage c-st genome.
噬菌体c-st是典型的肉毒梭菌C型神经毒素转化噬菌体。虽然噬菌体c-st基因组已经测序,但在其生物学和基因组方面没有太多信息。为了加深对该噬菌体水平基因转移的理解,我们研究了噬菌体c-st的核心基因组。首先,分析了噬菌体结构蛋白,结构蛋白的基因组模块为噬菌体c-st基因组的98.5- 157.5kbp。第二,将噬菌体c-st的基因组与一个相关的噬菌体c-468的基因组进行比较,发现噬菌体c-st的43-57 kbp和116.5-123 kbp的基因组与噬菌体468的基因组非常相似。第三,噬菌体基因组分配所必需的基因位于噬菌体c-st基因组的175.5- 178.5kbp处。根据这些结果,我推测核心基因组是噬菌体c-st基因组的1-43 kbp,57-116.5 kbp和123-186 kbp区域。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Phospholipase C produced by Clostridium botulinum types C and D: comparison of gene, enzymatic, and biological activities with those of Clostridium perfringens alpha-toxin.
C 型和 D 型肉毒梭菌产生的磷脂酶 C:与产气荚膜梭菌 α 毒素的基因、酶活性和生物活性的比较。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0.5
  • 作者:
    Ni Nengah Dwi Fatmawati;Y. Sakaguchi;T. Suzuki;M. Oda;K. Shimizu;Y. Yamamoto;J. Sakurai;O. Matsushita and K. Oguma
  • 通讯作者:
    O. Matsushita and K. Oguma
医薬ジャーナル社「病原菌の今日的意味 改訂4版」
Iyaku Journal Co., Ltd.《病原体的当今意义:修订版第4版》
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小熊惠二;阪口義彦;西河 淳
  • 通讯作者:
    西河 淳
C型ボツリヌス毒素変換ファージの構造タンパク質の解析
C型肉毒毒素转化噬菌体的结构蛋白分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    阪口義彦,内山淳平,小椋義俊,山本由弥子;鈴木智典;阪口政清;織田華絵;津田千秋;松崎茂展;林哲也;小熊恵二
  • 通讯作者:
    小熊恵二
The complete sequence of plasmid encoding neurotoxin gene in Clostridium botulinumtype B strain
B型肉毒梭菌神经毒素基因质粒编码全序列
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hosomi;K.;Sakaguchi;Y.;Goto;K.;Nakamura;K.;Kohda;T.;Mukamoto;M.;Iida;T.;Ogura;Y.;Hayashi;T.;Kozaki;S.
  • 通讯作者:
    S.
Improved adsorption of Enterococcus faecalis bacteriophageφEF24C caused by a point mutation in a tail fiber gene
尾纤维基因点突变引起的粪肠球菌噬菌体φEF24C的吸附改善
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Uchiyama J;Takemura I;Satoh M;Kato S;Ujihara T;Akechi K;Matsuzaki S;Daibata M
  • 通讯作者:
    Daibata M
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

SAKAGUCHI Yoshihiko其他文献

SAKAGUCHI Yoshihiko的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('SAKAGUCHI Yoshihiko', 18)}}的其他基金

Combined analysis of tertiary structure and function(s) of Clostridium botulinum type C and D phospholipase C
肉毒梭菌 C 型和 D 型磷脂酶 C 的三级结构和功能的联合分析
  • 批准号:
    21790421
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 2.75万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Genome-based analysis for tracing the origin and transfering the botulinum neurotoxin gene in Clostridium botulinum type E
基于基因组分析的 E 型肉毒梭菌中肉毒神经毒素基因的溯源和转移
  • 批准号:
    19790321
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 2.75万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了