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GC/MSメタボロミクス研究に資するノンターゲット解析プラットホームの開発

开发有助于GC/MS代谢组学研究的非目标分析平台

基本信息

批准号：
12J00973
负责人：
津川裕司
金额：
$ 0.64万
依托单位：
The Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2012
资助国家：
日本
起止时间：
2012 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12J00973/
关键词：
ガスクロマトグラフィー質量分析(GC/MS)データ解析再現性

项目摘要

本研究費により研究代表者は,以前開発したガスクロマトグラフィー質量分析(GC/MS)に資するデータ解析ソフトウェアAIoutputに系統誤差を排除するためのアルゴリズムを新たに搭載したAIoutput2を開発することで,高再現性データを取得するための基盤を構築した(投稿準備中).新ソフトウェアはさらに,データ解析結果の客観的な評価を可能にするアルゴリズム,さらには種々の統計解析を搭載しており,利便性・信頼性の向上が達成されている.また研究代表者は,データ解析だけでなくメタボロミクスのワークフロー全体を最適化することで,高再現性データを取得するためのメソッド開発にも取り組んだ.メタボロミクス研究では,生体試料の取得,前処理,分析,データ解析の各行程において誤差を含んでいる可能性があり,得られる解析結果及びその解釈は時として重大な間違いを引き起こす.研究代表者はこの問題に対してまず,研究室スケールにおいてSaccharomyces cerevisiaeのメタボローム情報を高再現性かつ高精度に取得可能なシステム開発に取り組んだ.当該研究では,出芽酵母を観測対象としたメタボロミクスを行う際の培養,クエンチング,分析,データ処理の各要素について特有の系統誤差を把握し,軽減することを主眼とした.培養については2回の継代作業を行うことで,菌体回収時の菌体の状況を一定に保つ工夫を行った.クエンチングについては,冷メタノールクエンチング,フィルターろ過法,水洗い法を行い,サンプルをGCIMS分析に供し,再現性を検討した.GC/MS分析においては,実験日間差,機差に基づく固有の系統誤差の発見と軽減を行った.一連の検討の結果,培養,クエンチング法,GC/MS分析条件の最適化に成功した(投稿準備中).

This study was conducted on behalf of the research representative, who used to conduct data analysis (GC/MS) to analyze the differences in the AIoutput system in order to eliminate the impact on the system. In this study, a new research partner, AIoutput2, is required to improve the performance of the research team, and the high reproducibility test has been completed. The results of the new data analysis show that the data of the customers may be affected, and the statistics of all kinds of data are analyzed in the same way, and the convenience and reliability of the data are analyzed in an upward fashion. You are a representative of the research community, and you need to know that all the people in the research community have made the most effective use of the information system. In the course of the study, the raw materials were obtained, the data were analyzed, analyzed and analyzed, and the errors of each stroke were analyzed, including the possibility that the errors were affected, the results of the analysis and the results of the analysis were obtained, and the critical conditions were introduced. The representative of the research team is concerned about the problem, and the research lab is concerned about the high-performance, high-precision, high-performance, high-precision, high-precision, high-precision, When it is time to study the system, the budding yeast is responsible for the development, analysis, analysis and management of the various elements of the system. During the second generation of the operation, the condition of the bacteria will be guaranteed when the bacteria are returned. We need to pay attention to each other. We need to know how to do it. We need to know how to do it. We need to use the method of washing. We use the GCIMS to analyze the supplier. GC