Elucidating the molecular mechanism of herbal medicine by the advances in computational mass spectrometry
Elucidating the molecular mechanism of herbal medicine by the advances in computational mass spectrometry
批准号:
21K18216
负责人:
津川 裕司
金额:
$16.64万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-07-09 至 2024-03-31
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英文摘要
本研究では、質量分析駆動型のオミクス解析を用いることで、生薬の薬理作用を分子レベルで理解することを目的としている。特に、甘草(Glycyrrhiza uralensis)は漢方製剤の約7割に用いられる重要な植物資源であり、抗腫瘍、抗菌、抗炎症、免疫調節作用など多様な生理活性が報告されていることから、本研究における主な題材と位置付けている。まず、抗炎症活性が知られている甘草由来天然物であるisoliquiritigenin(ILG)と甘草抽出エキス(GU)をマクロファージ由来細胞であるRAW264.7に添加し、化合物添加の有無におけるリポ多糖 (LPS) 誘導性炎症過程を評価した。LPS処理24時間の時点でILG 添加群とGU添加群の両方においてIL-6の有意な低下が確認できたことから、LPS処理から24時間後までの時系列親水性メタボローム、リピドーム、リン酸化プロテオームデータを取得し、解析を行った。炎症惹起24時間後のLPS群において、メタボローム解析の結果では、好気的解糖の亢進、クエン酸サイクル障害、アルギニン代謝(一酸化窒素産生)の亢進、脂肪酸や中性脂質の蓄積など、先行研究と同様の結果が得られた。その一方で面白いことに、甘草由来天然物添加群においてこれら代謝変化は減弱され、特にILG添加群においてはシトルリンの顕著な減少が見られ、一酸化窒素の産生抑制を示唆する結果を得た。またリン酸化プロテオームの結果からは、LPS刺激15分後において、解糖系の律速酵素である代謝酵素6-phosphofructokinaseのリン酸化レベルがGUおよびILG添加群で有意に低下しており、甘草天然物が解糖系亢進を抑制する分子機構が一部明らかとなった。
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RIKEN computational mass spectrometry
RIKEN计算质谱法
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
DOI:
10.1038/s41592-022-01710-0
发表时间:
2023-02
期刊:
NATURE METHODS
影响因子:
48
作者:
[Ni, Zhixu, Wolk, Michele, Jukes, Geoff, Espinosa, Karla Mendivelso, Ahrends, Robert, Aimo, Lucila, Alvarez-Jarreta, Jorge, Andrews, Simon, Andrews, Robert, Bridge, Alan, Clair, Geremy C., Conroy, Matthew J., Fahy, Eoin, Gaud, Caroline, Goracci, Laura, Hartler, Juergen, Hoffmann, Nils, Kopczyinki, Dominik, Korf, Ansgar, Lopez-Clavijo, Andrea F., Malik, Adnan, Ackerman, Jacobo Miranda, Molenaar, Martijn R., O'Donovan, Claire, Pluskal, Tomas, Shevchenko, Andrej, Slenter, Denise, Siuzdak, Gary, Kutmon, Martina, Tsugawa, Hiroshi, Willighagen, Egon L., Xia, Jianguo, O'Donnell, Valerie B., Fedorova, Maria]
通讯作者:
Fedorova, Maria
DOI:
10.1021/acs.estlett.1c00648
发表时间:
2021-10-12
期刊:
Environmental science & technology letters
影响因子:
10.9
作者:
[Zhang P, Carlsten C, Chaleckis R, Hanhineva K, Huang M, Isobe T, Koistinen VM, Meister I, Papazian S, Sdougkou K, Xie H, Martin JW, Rappaport SM, Tsugawa H, Walker DI, Woodruff TJ, Wright RO, Wheelock CE]
通讯作者:
Wheelock CE
代謝物質量分析インフォマティクスの最新の研究動向と展望
代谢物分析信息学最新研究趋势与展望
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tsugawa Hiroshi, Rai Amit, Saito Kazuki, Nakabayashi Ryo, 津川 裕司]
通讯作者:
津川 裕司
DOI:
10.1038/s41467-021-23953-9
发表时间:
2021-06-22
期刊:
Nature communications
影响因子:
16.6
作者:
[Schmid R, Petras D, Nothias LF, Wang M, Aron AT, Jagels A, Tsugawa H, Rainer J, Garcia-Aloy M, Dührkop K, Korf A, Pluskal T, Kameník Z, Jarmusch AK, Caraballo-Rodríguez AM, Weldon KC, Nothias-Esposito M, Aksenov AA, Bauermeister A, Albarracin Orio A, Grundmann CO, Vargas F, Koester I, Gauglitz JM, Gentry EC, Hövelmann Y, Kalinina SA, Pendergraft MA, Panitchpakdi M, Tehan R, Le Gouellec A, Aleti G, Mannochio Russo H, Arndt B, Hübner F, Hayen H, Zhi H, Raffatellu M, Prather KA, Aluwihare LI, Böcker S, McPhail KL, Humpf HU, Karst U, Dorrestein PC]
通讯作者:
Dorrestein PC
共 6 条
質量分析データリポジトリの大規模再解析による代謝研究基盤の構築
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批准号:24K02011
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.9万
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财政年份:2024
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负责人:津川 裕司
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依托单位:
GC/MSメタボロミクス研究に資するノンターゲット解析プラットホームの開発
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批准号:12J00973
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.64万
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财政年份:2012
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负责人:津川 裕司
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依托单位:
海外基金