網羅的遺伝子解析を用いたヒトiPS細胞の血液細胞分化誘導における重要な因子の同定
網羅的遺伝子解析を用いたヒトiPS細胞の血液細胞分化誘導における重要な因子の同定
批准号:
12J03322
负责人:
西澤 正俊
金额:
$1.28万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2012
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2012 至 2013
中文摘要
ヒトips細胞やES細胞は、株ごとにその分化能が異なることが過去の報告からも知られており、中には分化能が劣る株も存在する。この大きな株間差ははヒトiPS細胞/ES細胞の臨床応用を考慮する上で問題点の一つとなりうる。本研究はこのiPS細胞の分化能、特に血液分化能の株間差の原因となっている因子を解明することを目的とした。そのために、本研究ではまず京都大学iPS細胞研究所にて作成されたヒトiPS細胞株と中心に約40細胞株のヒトiPS/ES細胞の血液分化能を調べた。同時にこれらの株の遺伝子発現やDNAメチル化状態を、それぞれmRNAマイクロアレイやDNAメチル化アレイを用いて調べて、iPS/ES細胞の血液分化能と相関する分子マーカーの検索を行った。これらの各々ヒトiPS/ES細胞の血液分化能とそれぞれの株の遺伝子発現やDNAメチル化状態の関連を調べることで、我々は複数の良好な血液細胞分化と関連する分子マーカーを見いだすことができた。さらにはこれらの分子マーカーを用いることで、ヒトiPS細胞やES細胞の分化は、未分化なiPS細胞の特定の遺伝子の遺伝子発現やDNAメチル化状態を調べることで予測可能であることが分かった。上記に加えて抽出された因子の機能解析も行い、抽出された因子が血球分化と関連するメカニズムについても明らかにすることができた。さらにはこれらの知見をもとに、さらにヒトiPS細胞の血液分化効率を改善することができた。本研究はヒトiPS細胞、ES細胞の株間差の分子メカニズムを明らかにするとともに、ヒトiPS細胞の血液分野での臨床応用に大きく貢献すると考えられる。
英文摘要
ヒトips細胞やES細胞は、株ごとにその分化能が異なることが過去の報告からも知られており、中には分化能が劣る株も存在する。この大きな株間差ははヒトiPS細胞/ES細胞の臨床応用を考慮する上で問題点の一つとなりうる。本研究はこのiPS細胞の分化能、特に血液分化能の株間差の原因となっている因子を解明することを目的とした。そのために、本研究ではまず京都大学iPS細胞研究所にて作成されたヒトiPS細胞株と中心に約40細胞株のヒトiPS/ES細胞の血液分化能を調べた。同時にこれらの株の遺伝子発現やDNAメチル化状態を、それぞれmRNAマイクロアレイやDNAメチル化アレイを用いて調べて、iPS/ES細胞の血液分化能と相関する分子マーカーの検索を行った。これらの各々ヒトiPS/ES細胞の血液分化能とそれぞれの株の遺伝子発現やDNAメチル化状態の関連を調べることで、我々は複数の良好な血液細胞分化と関連する分子マーカーを見いだすことができた。さらにはこれらの分子マーカーを用いることで、ヒトiPS細胞やES細胞の分化は、未分化なiPS細胞の特定の遺伝子の遺伝子発現やDNAメチル化状態を調べることで予測可能であることが分かった。上記に加えて抽出された因子の機能解析も行い、抽出された因子が血球分化と関連するメカニズムについても明らかにすることができた。さらにはこれらの知見をもとに、さらにヒトiPS細胞の血液分化効率を改善することができた。本研究はヒトiPS細胞、ES細胞の株間差の分子メカニズムを明らかにするとともに、ヒトiPS細胞の血液分野での臨床応用に大きく貢献すると考えられる。
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会议论文
Comprehensive comparison of gene expression, genomic DNA methylation, and in vitro hematopoietic differentiation among many human iPS and ES cell lines
多种人类 iPS 和 ES 细胞系的基因表达、基因组 DNA 甲基化和体外造血分化的综合比较
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Masatoshi Nishikawa, Kazuhisa Chonnhayashi, Akiko Oishi, Ikue Takei, Misato Nishikawa, Yoko Morioka, Akilumi Taknori-Kondo, Shinya Yamanaka, and Yoshinori Yoshida]
通讯作者:
and Yoshinori Yoshida
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Masatoshi Nishizawa, Kazuhisa Chonabayashi, Akiko Oishi, Ikue Takei, Ilisato Nishikawa, Akifumi Takaori-Kondo, Shinya Yamanaka, and Yoshinori Yoshida]
通讯作者:
and Yoshinori Yoshida
人工多能性幹細胞の選別方法および血球への分化誘導促進法
筛选诱导多能干细胞并促进其分化为血细胞的方法
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
疲弊化T細胞のシングルセルオミックス解析とリプグラミングによるT細胞疲弊の克服
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批准号:20K21548
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2020
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负责人:西澤 正俊
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依托单位:
海外基金