ヒト白血球抗原によるHIVゲノムの多様性獲得の研究
ヒト白血球抗原によるHIVゲノムの多様性獲得の研究
批准号:
12J04376
负责人:
近田 貴敬
金额:
$1.73万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2012
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2012-04-01 至 2015-03-31
中文摘要
我々は、昨年度までのHLA-C*03サブタイプ間のHLA-associated polymorphism (HLA-AP)の解析により、ペプチド結合部位の外側(91番アミノ酸)のアミノ酸の違いが、ペプチドとの結合またはT細胞レセプター(TCR)やNK細胞レセプター(KIR)との相互作用に寄与している可能性を示唆し、さらに特定のHLA-C*03拘束性HIV-1エピトープペプチドに対する親和性が両サブタイプ間で異なることを明らかにした。そこで本年度の研究として、エピトープペプチドとのペプチド解離速度、TCRやKIRとの会合に与える影響を詳細に解析した。まず、ペプチド結合能の安定性に差があるかどうかを調べた結果、HLA-C*03:03およびC*03:04の間でGag-YL9およびGag-KL9ペプチドの解離速度に有意な差は見られなかった。また、YL9特異的Bulk T細胞のHLA-C*03:03-YL9およびC*03:04-YL9テトラマーに対する結合親和性は、同等であることが明らかになった。さらに、YL9およびKL9特異的CTLクローンの認識能を調べた結果、YL9特異的CTLクローンではHLA-C*03:03およびC*03:04の間で有意な差が見られたが、KL9特異的CTLクローンではその認識能に差が見られなかった。また、YL9特異的CTLクローンおよびNK細胞によるHIV-1に対するウイルス増殖抑制能を比較した結果、HLA-C*03:03およびC*03:04の間で有意な差は見られなかった。これまでのHLA-C*03サブタイプの詳細な解析により、ペプチド結合部位の外側のわずかな立体構造の変化によってペプチド結合能に差が生じることで、異なるHIV-1アミノ酸変異が選択されている可能性が示唆された。本研究は、HIV-1のアミノ酸変異選択および多様性獲得の複雑なメカニズムの一端を解明するために、非常に重要であると考えられる。
英文摘要
我々は、昨年度までのHLA-C*03サブタイプ間のHLA-associated polymorphism (HLA-AP)の解析により、ペプチド結合部位の外側(91番アミノ酸)のアミノ酸の違いが、ペプチドとの結合またはT細胞レセプター(TCR)やNK細胞レセプター(KIR)との相互作用に寄与している可能性を示唆し、さらに特定のHLA-C*03拘束性HIV-1エピトープペプチドに対する親和性が両サブタイプ間で異なることを明らかにした。そこで本年度の研究として、エピトープペプチドとのペプチド解離速度、TCRやKIRとの会合に与える影響を詳細に解析した。まず、ペプチド結合能の安定性に差があるかどうかを調べた結果、HLA-C*03:03およびC*03:04の間でGag-YL9およびGag-KL9ペプチドの解離速度に有意な差は見られなかった。また、YL9特異的Bulk T細胞のHLA-C*03:03-YL9およびC*03:04-YL9テトラマーに対する結合親和性は、同等であることが明らかになった。さらに、YL9およびKL9特異的CTLクローンの認識能を調べた結果、YL9特異的CTLクローンではHLA-C*03:03およびC*03:04の間で有意な差が見られたが、KL9特異的CTLクローンではその認識能に差が見られなかった。また、YL9特異的CTLクローンおよびNK細胞によるHIV-1に対するウイルス増殖抑制能を比較した結果、HLA-C*03:03およびC*03:04の間で有意な差は見られなかった。これまでのHLA-C*03サブタイプの詳細な解析により、ペプチド結合部位の外側のわずかな立体構造の変化によってペプチド結合能に差が生じることで、異なるHIV-1アミノ酸変異が選択されている可能性が示唆された。本研究は、HIV-1のアミノ酸変異選択および多様性獲得の複雑なメカニズムの一端を解明するために、非常に重要であると考えられる。
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日本人慢性HIV-1感染者におけるHLA-Associated Polymorphismの解析
日本慢性HIV-1感染者HLA相关多态性分析
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[後藤和紀, 伊藤桂介, 伊藤弘毅, 齋藤伸吾, 岸田英夫, 佐々木孝彦, 谷口弘三, 岩井伸一郎, 近田 貴敬]
通讯作者:
近田 貴敬
The impact of amino-acid substitution at a position outside the peptide binding groove of HLA-C subtypes in HIV-1-specific T cell recognition
HLA-C亚型肽结合沟外氨基酸取代对HIV-1特异性T细胞识别的影响
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takayuki Chikata, Hayato Murakoshi, Madoka Koyanagi, Tomohiro Akahoshi, Shinichi Oka, and Masafumi Takiguchi]
通讯作者:
and Masafumi Takiguchi
日本人HIV-1慢性感染者におけるHLAに関連したHIV-1多型の解析と非アジア人コホートとの比較解析
日本慢性感染 HIV-1 患者的 HLA 相关 HIV-1 多态性分析及与非亚洲人群的比较分析
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[近田 貴敬, Jonathan M Carlson, 田村 美子, Mohamed Ali Borghan, 成戸 卓也, 端本 昌夫, 村越 勇人, Anh Q. Le, Simon Mallal, Mina John, 潟永 博之, 岡 慎一, Zabrina L Brumme, 滝口 雅文]
通讯作者:
滝口 雅文
DOI:
10.1186/1742-4690-9-s2-p269
发表时间:
2012-09-13
期刊:
Retrovirology
影响因子:
3.3
作者:
[Chikata T, Carlson J, Tamura Y, Brumme Z, Naruto T, Hashimoto M, Borghan M, John M, Mallal S, Gatanaga H, Oka S, Takiguchi M]
通讯作者:
Takiguchi M
HIV-1 polymorphisms associated with 4-digit HLA alleles in Japanese individuals chronically infected with the clade B virus
慢性感染 B 分支病毒的日本个体中与 4 位 HLA 等位基因相关的 HIV-1 多态性
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takayuki Chikata, Jonathan M Carlson, Yoshiko Tamura, Mohamed Ali Borghan, Takuya Naruto, Masao Hashimoto, Hayato Murakoshi, Simon Mallal, Mina John, Hiroyuki Gatanaga, Shinichi Oka, Zabrina L. Brumme and Masafumi Takiguchi]
通讯作者:
Zabrina L. Brumme and Masafumi Takiguchi
共 6 条
HIVハイリスク非感染者における感染防御に寄与する細胞傷害性T細胞の同定
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批准号:22K08603
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2022
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负责人:近田 貴敬
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依托单位:
海外基金